典型病例為粒細胞缺乏或接受廣譜抗生素、免疫抑製劑和糖皮質激素過程中出現不能解釋的發熱，胸部症狀以幹咳、胸痛最常見。咯血雖不如前兩種症狀常見，但十分重要，具有提示性診斷價值。當肺內病變廣泛時則出現氣急、甚至呼吸衰竭。此外，尚可出現胃腸出血及各種中樞神經係統症狀。肺部體征取決於病變的性質和範圍，當累及胸膜時可出現胸膜摩擦感或摩擦音。
如前所述，在高危患者出現不能解釋的發熱、咯血和肺浸潤時應充分考慮本病的可能。急性侵襲型肺曲黴病的確診是困難的。痰標本曲黴培養陽性率甚低(8%～34%)，而且陽性結果可以是源於本菌在上呼吸道的定植汙染，應結合臨床考慮，如果患者有相應基礎疾病或高危因素存在則有重要參考價值。
確診有賴於應用防汙染技術從下呼吸道采集分泌物培養或作肺活檢病理學檢查。但這種創傷性診斷技術的應用往往受到患者臨床嚴重病情的限製，其陽性率也受到操作者技術水平的影響。無論如何，本病預後在很大程度上取決於早期診斷和早期治療，故對於創傷性診斷技術應取積極態度。血清免疫學方法檢測抗體其敏感性甚低，很少應用價值。目前正研究檢測曲黴抗原以診斷本病，據報道放射免疫技術檢測血清曲黴抗原敏感性和特異性分別達到74%和90%，值得深入研究和積累經驗。
