醫院又名福建省第二人民醫院、福建中醫藥大學第二臨床醫學院，位於福州市五四路282號。醫院1982年批準建立，1990年正式開診，是一所集醫療、教學、科研為一體的三級甲等綜合性中醫醫院。為全國衛生係統先進集體、福建省精神文明單位、福建省平安醫院，省、市、鐵路等醫保中心定點醫療機構，國家中醫藥管理局基層中醫藥適宜技術推廣省級基地、中醫藥臨床研究倫理審查評估平台。2017年被納入國家中醫藥傳承創新工程項目儲備庫，並被確定為福建省名優中醫院建設單位。
現有院本部和東二環兩個院區，占地麵積75畝(其中自有麵積50畝)，建築麵積7.6萬㎡。2017年門診量156萬人次，年出院26277人次。醫院編製床位1000張，開放728張。設臨床科室32個、病區13個、醫技科室12個、臨床教研室13個、行政職能科18個。擁有64排螺旋CT、3.0T磁共振，以及具有中醫特色的各種中醫治療設備如電動直立床、中藥熏洗及熏蒸、全自動智能型溫熱牽引係統等大批先進的醫療儀器設備。
醫院中醫特色明顯，有眾多重點學科和重點專科。脾胃病科、神誌病科為國家臨床重點專科建設項目；脾胃病科為國家中醫藥管理局重點專科；中醫脾胃醫學中心為福建省高水平臨床醫學中心、醫療“創雙高”項目；腎病科、肛腸科、神誌病科、治未病科、護理學科為國家中醫藥管理局重點專科建設項目；脾胃病科、康複科、腦血管科、腎病科、呼吸科、中醫婦科、肛腸科、心衰專病、乳腺科等為福建省中醫重點專科（專病）；呼吸科、風濕內分泌科、治未病中心、腦病科、針灸科為福建省臨床重點專科建設項目（中醫類）。中醫皮膚科、斷指再植、老年醫學等專業優勢明顯。
醫院名醫薈萃，有副主任醫師以上180餘人，擁有國醫大師1人、全國名中醫1人、全國中醫名師1人，福建省名中醫10人。享受國務院政府特殊津貼3人，任國家級學會常委以上20人,省級學會副主委以上63人，有6個國家級名老中醫工作室。
醫院有2個博士學位培養點、14個碩士學位培養點。近五年來中標各類科研課題300餘項，省部級以上課題73項。國家級科研項目6項，獲科研成果獎9項、**論文11篇。獲福建省科技進步獎6項、國家專利15項、SCI論文31篇、發表論文394篇，擁有福建省衛計委重點研究室6個。
福建中醫藥研究院臨床醫學研究所、福建中醫藥大學針灸研究所、福建中西醫結合研究院腫瘤研究所、福建中西醫結合研究院白內障近視研究所掛靠我院，並附設福建正清司法鑒定所（親子鑒定）。
醫院始終把患者的利益擺在首位，旨在為患者提供最適宜的優質醫療服務。堅持“小綜合、大學科”的辦院方向，規模不斷擴大，中醫藥學術地位不斷提升，醫院正朝著國內一流，國際知名，多個學科特色明顯的三級甲等綜合性現代科研型中醫醫院邁進。
東二環分院
位於福州市連江北路46號，開放床位150張，是福建省“120”急救聯動單位。年門診量超20萬人次，設有急診、內、外、婦產、兒、口腔、耳鼻喉、肛腸、康複、體檢等15個臨床科室、醫技輔助科室，以婦產科、手足創傷顯微外科為重點特色科室。婦產科擁有標準層流產房、先進設備開展宮腔鏡、腹腔鏡及乳腺微創手術，中西醫診療特色突出；手足微創顯微外科是以手術治療高難度斷指掌、斷臂等各類手足外傷、恢複手足功能為特色的專科，在省內同專業醫療單位中居領先地位。
體檢中心
成立於2002年，年體檢量15多萬人次，為福建省規模較大的健康管理服務機構，是國家中醫藥管理局第二批“治未病”預防保健服務試點單位，是國家中醫藥管理局中醫預防醫學重點學科和國家中醫藥管理局治未病重點專科建設單位，全國健康管理示範基地旗艦單位。中心麵積近8000平方米，現有醫護員工263名，擁有超億元的健康體檢、健康檢測、健康評估和幹預設備，自主研發多套健康管理信息係統軟件。中心曾參與國家973（國家重點基礎研究發展計劃）、863（國家高技術研究發展計劃）、國家中醫藥管理局、福建省教育廳、科技廳和衛生廳等多項課題研究，積累了豐富的科研成果，並用於指導體檢實踐，為體檢者提供日益優質的體檢服務。
