福建省腫瘤醫院於1979年籌建，1984年收治病人，1986年正式掛牌開院；福建省腫瘤防治辦公室掛靠醫院；1997年被國家衛生部評為三級甲等腫瘤醫院；2001年成立福建省腫瘤研究所，與醫院合署辦公。2013年被列為腫瘤科國家臨床重點專科建設單位，2016年成為福建醫科大學附屬腫瘤醫院，2017年被確認為福建省高水平癌症醫學中心建設單位。2020年被列為爭創國家癌症區域醫療中心建設單位。
醫院作為承擔福建腫瘤防治與研究的重要平台，形成腫瘤領域的技術高地、學科高地、人才高地和服務高地，在腫瘤防控和綜合診療方麵形成特色優勢，在全省及周邊地區的腫瘤防治工作中發揮著龍頭作用。目前已形成集國家臨床重點專科、國家藥物臨床試驗機構、福建省腫瘤轉化醫學重點實驗室、福建省腫瘤生物治療重點實驗室、福建省腫瘤精準醫療產業技術創新研究院、福建省腫瘤精準診斷與免疫治療工程研究中心、福建省腫瘤放射與免疫治療臨床醫學研究中心和福建省肝膽胰腫瘤臨床醫學研究中心為一體的腫瘤醫教研防高地。
醫院編製床位1600張，年收治腫瘤病人8萬餘人次，設有37個臨床科室、28個病區、11個醫技科室和14個腫瘤相關專業研究室。現有職工2185人，專業技術人員1963人，其中正高職稱103人，副高職稱249人，研究生導師53人。百千萬人才工程國家級人選1人，國家衛生健康有突出貢獻中青年專家1人，國務院特殊津貼專家8人，省勞動模範1人，省優秀人才2人，省“雙百計劃”人選4人，省衛生健康有突出貢獻中青年專家4人。擔任國家級學會、協會及其專科分會名譽主任委員1名、副主任委員21名、常委23名。
醫院擁有完善的腫瘤綜合治療技術體係，形成了以腫瘤外科、腫瘤放療、腫瘤內科、中西醫結合、新型免疫治療、射頻消融、介入治療和熱療等為特色的腫瘤多學科規範化綜合治療優勢，能為病人提供規範的個體化診療方案。2018年醫院入選首批全國消化腫瘤MDT培訓示範中心，被國家衛健委確定為首批腫瘤多學科診療試點醫院。醫院綜合實力和影響力在國內省級腫瘤專科醫院中名列前茅，2019年國家衛健委考核評比位列全國三級腫瘤專科醫院第8名，等級為A；中國醫學科學院中國醫院科技量值（STEM）腫瘤學專科排行榜，排名全國第8位。鼻咽癌、肝癌、肺癌、消化道腫瘤、婦科腫瘤、淋巴瘤等高發腫瘤的綜合治療居於省內領先、國內先進水平，放射治療、胸部腫瘤、腹部腫瘤、腫瘤病理等專業成為特色專業。福建省腫瘤放射治療質量控製中心、福建省腫瘤化學治療質量控製中心、福建省腫瘤免疫治療質量控製中心、福建省抗癌協會、福建省醫學會腫瘤學分會、福建省醫學會放射腫瘤學分會、福建省醫學會婦科腫瘤學分會、福建省核學會均掛靠在醫院。
醫院積極打造腫瘤領域的研究技術體係，形成以轉化醫學、精準醫學、交叉科學為特色的創新平台；以問題和需求為導向，形成臨床診療和科技創新相互促進的發展態勢。近5年獲省科技進步獎一等獎2項、二等獎1項、三等獎3項。
醫院牽頭協調全省腫瘤防控工作，構建全省腫瘤防控三級網絡，承擔國家重大公共衛生項目，實施全省惡性腫瘤發病、死亡監測任務，建立健全癌症監測體係，摸清全省惡性腫瘤發病與死亡，目前已在15個縣建立12個登記處，占全省戶籍人口的20.2%。承擔腫瘤篩查及早診早治項目，被國家癌症中心授予“省級管理先進單位”。2014年起，每年出版《福建省腫瘤登記年報》。
醫院堅持黨建引領保障，深化文明創建，秉持“團結嚴謹敬業奉獻”的院訓，形成精神文明與業務工作交彙融合、雙向提升的良好局麵，連續蟬聯四屆全國文明單位，先後獲得中國百佳最具影響力腫瘤醫療機構、全國醫院醫保管理先進單位、全國模範職工之家、全國科教文衛體係統先進工會組織、全國公共機構能效領跑者、全國節約型公共機構示範單位、人文醫院文化建設典型、福建省衛生健康係統先進集體等榮譽稱號；先後獲得南丁格爾獎、全國衛生係統先進工作者、全國優秀科技工作者、全國醫德標兵、全國創先爭優先進女職工、全國優秀工會工作者等國家級榮譽近40人次。
新時代新階段，醫院堅持以習近平新時代中國特色社會主義思想為指導，秉持人民至上、生命至上的理念，貫徹新發展理念，構建新發展格局，以穩中求進為工作總基調，以推動高質量發展為主題，以提升醫療服務能力為主線，以改革創新為動力，全方位加快國家癌症區域醫療中心建設，全麵構建環境優美、技術優良、人文優聚的“三優”醫院，讓高品質的健康服務惠及千家萬戶。
