南京腦科醫院，又名南京醫科大學附屬腦科醫院，江蘇省精神衛生中心，始建於1947年，是我國最早的國立神經精神病專科醫院，承擔著南京市、江蘇省乃至全國神經、精神疾病的醫療、康複、預防、教學、科研、司法鑒定等任務，還承擔著相關政府指令性工作及突發應急事件的心理救援等處置任務，在國家重大城市任務和突發公共衛生事件處置中，發揮社會維穩作用。
醫院設有床位1072張，職工1400餘人，年門診量逾80萬人次，年收住院病人1.8萬人次。設有精神科、神經內科、神經外科、醫學心理科、老年醫學科、老年精神科、中醫科、醫學康複科、心血管內科、兒童心理衛生研究中心、癲癇診療中心、腦血管病救治中心等16個臨床科室和10個醫技科室，提供了具有專科特色的臨床服務，包括省級抑鬱症診療中心、孤獨症診療中心等。醫院擁有超高場3.0T磁共振機、數字減影血管造影機（DSA）及64排128層CT機各2台、CTF-275信道腦磁圖、伽瑪刀等大批先進設備，為臨床及時診斷、疾病治療提供了有力保障。
醫院現為國家級博士後科研工作站，國家衛生計生委專科醫師進修基地，國家藥物臨床試驗機構。精神科為首批國級家臨床重點專科、江蘇省重點學科，神經外科為江蘇省臨床重點專科、江蘇省科教強衛工程醫學創新團隊，醫學心理科、神經內科為江蘇省臨床重點專科，其他科室為南京市醫學重點專科。開辦《臨床神經病學雜誌》、《臨床精神醫學雜誌》、《臨床神經外科雜誌》等3種學術期刊，全國發行。
醫院始終堅守“專科立院”之宗旨，致力於多學科的發展與融合，不斷提升醫院的綜合實力與核心競爭力，整體實力保持在全國前列。在2016年11月複旦大學醫院管理研究所發布的最新《中國最佳醫院排行榜》（專科彙總）中連續5年入選全國百名最佳醫院，精神醫學在《中國醫院最佳專科聲譽排行榜》連續6年位列全國第6位。先後被衛生部、人事部授予“全國百佳醫院”、“全國衛生係統先進集體”稱號，連續多年獲得江蘇省人民政府、南京市人民政府“先進單位”、“文明單位”等榮譽。
