念珠菌廣泛存在於自然界及正常人的口腔、消化道、上呼吸道、陰道和皮膚上。正常情況下，念珠菌與人體處於共生狀態，並不致病，僅在一定條件下方可致病，故稱之為條件致病菌。病原菌侵入機體後能否致病取決於致病菌的數量、毒力、入侵途徑與機體對病原菌的抵抗力。當患者有糖尿病、腫瘤、慢性消耗性疾病以及長期使用廣譜抗生素、糖皮質激素及免疫抑製劑等導致機體抵抗力下降時，均易發生感染。也可由於長期放置導管、插管、器官移植、放療、化療而致病。本病多數屬於內源性感染，少數為外源性感染。
念珠菌屬中約有8種菌能引起人體致病，但白色念珠菌為常見的致病菌，毒力最強。其它幾種念珠菌因致病力弱，較少引起感染，隻有當人體免疫力特別低下時，這些念珠菌才會單獨或與白色念珠菌協同致病。
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