腎萎縮一般會出現左腎萎縮、右腎萎縮及雙腎萎縮症狀。一般來說引起腎萎縮原因有以下幾點：首先得知腎萎縮後需考慮為先天性腎發育不全，其次考慮為末期腎髒疾病，即腎衰竭、尿毒症或某些急性病症。如：急性腎小球性疾病、糖尿病性腎硬變、腎移植排異、慢性腎小球腎炎、腎皮質壞死、Alport綜合征、急性腎小管壞死、高血壓性腎硬化。
雙側腎髒或一側腎髒縮小多是慢性腎盂腎炎的病因，這也是腎萎縮的一個常見原因。
雙腎縮小一般來說慢性腎病發展到腎功能不全，尤其是腎衰竭、尿毒症時，血肌酐、尿素氮升高，腎髒損傷嚴重，腎髒實質受到傷害，腎髒會縮小。所以提醒腎萎縮病人一定要對此引起高度重視，腎髒疾病隱匿性很強，如果腎小球濾過率低於50%，即腎髒損傷嚴重時臨床症狀才相應產生。腎萎縮確診後一定要積極的查找原因，以便排查病情。
此外，腎萎縮原因還有兩點：腎結核(單側腎髒縮小，伴對側腎髒積水或代償性增大)、腎動脈狹窄及先天性發育不全。
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