一般認為，尿道感染的途徑有上行感染、血行感染、淋巴道感染和直接感染四種方式。
(1)上行感染：絕大多數尿感是由上行感染引起的。正常情況下，尿道口及其周圍是有細菌寄生的，但一般不引起感染。當機體抵抗力下降或尿道粘膜有輕微損傷時，或者細菌的毒力大，粘附尿道粘膜和上行的能力強，容易侵襲膀胱和腎髒，造成感染。由於女性尿道口靠近肛門，且女性尿道遠較男性為短而寬，女嬰的尿道口 常被糞便汙染，故更易致病。
(2)血行感染：細菌從身體內的感染灶(如扁桃體炎、鼻竇炎、齲齒或皮膚感染等)侵入血流，到達腎髒，先在腎皮質引起多發性小膿瘍，然後，沿腎小管向下擴散至腎乳頭和腎盞、腎盂粘膜，但炎症亦可從腎乳頭部有輕微損傷的乳頭集合管(如尿中的結晶損傷)開始，然後向上向下擴散。血行感染途徑較為少見，不及 10%。血行感染比較多見於新生兒，或金黃色葡萄球菌敗血症患者的血行性腎感染。
(3)淋巴道感染：下腹部和盆腔器官的淋巴管與腎周圍的淋巴管有多數交通支，升結腸與右腎之間也有淋巴管溝通。當盆腔器官炎症、闌尾炎和結腸炎時，細菌也可從淋巴道感染腎髒。這種感染途徑更為少見，甚至於這種感染途徑是否存在，目前也有爭論。
(4)直接感染：外傷或鄰近腎髒的髒器有感染時，細菌可直接侵入腎髒引起感染，但是，這種情況臨床上是十分罕見的。
