鈣化灶一般是由炎症和結核引起，如肺結核在治愈後也可形成肺部鈣化灶，類似於疤痕。肝內有鈣化點可能是肝內膽管壁部分鈣化.它的原因多由於炎症、結核等引起，也可能是肝內鈣化灶及肝組織局部壞死後的纖維化瘢痕。
肝內鈣化灶的病因
一、肝內慢性炎症或創傷。肝內慢性炎症以肝結核和肝膿腫多見，少見於黴菌病、布魯菌病、門靜脈血栓形成和結節性病。這類鈣化灶缺乏特征性B超和CT圖像，難於與原發性肝癌和肝內轉移瘤鑒別。但是，X線平片的診斷很大，平片上50%肝區見均勻彌散於肝左右兩葉的鈣化灶，90%大小為8~12mm，個別融合性鈣化灶可達3~4cm，而且65%患者胸片上可見肺結核征象。
二、寄生蟲感染。肝髒寄生蟲病也可以出現肝內鈣化灶，常見有肝包蟲病和肝血吸蟲病，前者多見於牧民，後者多為疫區的農民和漁民。肝包蟲病肝髒的病灶是無數小囊泡集而成，呈彌漫浸潤生長，與正常肝組織界限不清楚，囊璧有鈣鹽沉積。
三、肝內膽管結石，出現肝內膽管結石後會引起肝髒組織局部壞死的纖維化痕跡，引起結石在阻塞部位的小膽管的擴張。
四、有的是先天發育形成，多是由於在出生之前在子宮內胎兒已經有肝內鈣化灶的形成，常合並先天畸形，發現率為0.057%。
五、肝髒上麵的一些疾病，是引起肝內鈣化灶的常見原因，例如肝囊腫、肝腫瘤、原發性肝癌等。
