腸道是人體內最大的微生物環境，有超過100種細菌在腸道內生活，影響消化和過敏反應，因此也被稱為“第二大腦”。但這些組成“第二大腦”的微生物，可能會影響真正的大腦，實現“肉體控製精神”的反攻。
腸道菌與自閉症、抑鬱症
長期以來，研究人員發現，大多數自閉症患者都有某些胃腸功能異常，如消化不良或食物過敏等，並且自閉症患者的腸道菌群與對照組存在顯著差異。這促使科學家們進一步研究腸道微生物與自閉症的潛在關係。
加州理工學院的微生物學家將從人體腸道中提取的脆弱擬杆菌飼喂給有自閉症症狀的小鼠，結果發現它們的焦慮程度降低，與其他小鼠的互動性增加。之後，馬茲曼尼亞又確定自閉症的發生可能與腸道菌產生的4-乙基苯酚硫酸鹽(4EPS)有關。有自閉症症狀的小鼠，血液中4EPS的水平要比普通小鼠高40多倍。
此外，科學家們也發現腸道菌群能影響焦慮和抑鬱。現已有證據證明，乳杆菌屬和雙歧杆菌屬的兩種細菌能減少小鼠的焦慮樣行為，並減少與壓力相關的激素分泌水平。
腸道菌可作精神藥物?
腸道菌群影響大腦的機製還不明確，但可以確定的是，腸道細菌能產生與情緒調節相關的某些神經遞質(如多巴胺、5-羥色胺等)，從而影響人的心情或愉悅或低落。
在嬰兒出生的1周至1個月，腸道菌群逐漸形成，在成長中免疫係統學會識別哪些細菌是身體的正常居住者，哪些是侵入者。而從宏觀來看，細菌在人體內已經存在了幾百萬年，在其不斷的進化過程中，足以有一部分發展出了影響宿主行為的方式。這些長久伴隨人類的細菌，可能比藥物更了解人類身體的需要。有朝一日，這些微生物或許可以在疾病治療上發揮作用，並且比藥物治療更加精確。
