甲狀腺功能減退伴發的精神障礙的病因尚不清楚，有自體免疫學說、腦循環障礙說、發育缺陷說等三種學說。具體的學說介紹如下：
1、自體免疫學說在克汀病人的血液中被證明有高效價甲狀腺抗體。甲狀腺功能減退起免疫作用的主要是淋巴細胞，提示B淋巴細胞和T淋巴細胞係統其抗原抗體產生異常。
2、腦循環障礙說據研究，在甲狀腺素不足或缺乏時代謝發生障礙，使腦血流量減少，血管阻力增大，因而氧耗量和葡萄糖耗量都減少，導致腦缺氧和糖代謝障礙，腦水腫可能與精神活動減退有關。心髒和其他器官也出現低氧血症。
3、發育缺陷說有研究發現，患者腦的蛋白合成和脂肪合成都有異常，並有細胞發育不良和髓鞘形成的缺陷。
甲狀腺功能減退伴發的精神障礙主要包括克汀病及粘液水腫精神障礙，精神障礙是甲狀腺功能減退的常見征象。甲狀腺功能減退伴發的精神障礙暫無並發症。
甲狀腺功能減退伴發的精神障礙主要包括克汀病及粘液水腫精神障礙。具體的表現如下：
一、克汀病
1、軀體發育矮小，智能缺陷。
2、行動遲鈍。
3、思維緩慢不靈活，少抽象思維能力。
4、易激惹、多疑。
二、粘液水腫
1、思維意誌及活動過程的逐漸變慢。缺乏驅動力和自發活動。
2、精神萎靡，不耐寒冷，嗜睡。
3、出現心境壓抑、抑鬱、猜疑、妄想。
預防甲狀腺功能減退（甲減）伴發的精神障礙，主要是預防甲狀腺功能減退以及防止甲減病情惡化具體的預防措施如下：
一、甲減的病因預防
1、呆小症的病因預防
地方性的呆小症，胚胎時期孕婦缺碘是發病的關鍵散發性的呆小症，多由孕婦患的某些自身免疫性甲狀腺疾病引起，明確病因進行預防母體妊娠期服用抗甲狀腺藥物盡量避免劑量過大，加用小劑量幹甲狀腺製劑，並避免其他致甲狀腺腫的藥物
2、成人甲狀腺功能減退的預防
及時治療容易引起甲減的甲狀腺疾病，防止手手術治療甲狀腺疾病或放射性131碘治療甲亢引起的甲減，
二、積極防止甲減病情惡化
早期診斷、早期治療是防止甲減病情惡化的關鍵早期采用中醫藥治療可有效的預防並發症的發生注意生活調理避免加重病情因素的刺激，
甲狀腺功能減退伴發的精神障礙的診斷除了依靠臨床表現，輔助檢查也是必不可少的診斷方法。常用的檢查如下：
1、一般檢查血常規可見輕度貧血；膽固醇、甘油三脂、尿酸平可有不同程度的升高。
2、甲狀腺功能檢查原發性甲減患者T3、T4降低，TSH水平升高；亞臨床甲減僅有TSH增高、T4和FT4正常。
3、抗體檢查甲狀腺球蛋白抗體(TgAb)和過氧化酶抗體(TPOAb)是確定原發甲減病因的重要指標，在橋本甲狀腺炎中甲狀腺自身抗體明顯升高。
4、其他檢查包括腦電圖檢查、基礎代謝率測定、X線檢查、心電圖檢查、超聲心動圖檢查、肌酸磷酸激酶檢測。
甲狀腺功能減退伴發的精神障礙患者需選用適量海帶、紫菜，可用碘鹽、碘醬油、碘蛋和麵包加碘。炒菜時要注意，碘鹽木宜放入沸油中，以免碘揮發而降低碘濃度。蛋白質補充可選用蛋類、乳類、各種肉類、魚類。
忌各種生甲狀腺腫物質，如卷心菜、白菜、油菜、木薯、核桃等；忌富含膽固醇的食物，如奶油、動物腦及內髒等；限用高脂肪類食品，如食油、花生米、核桃仁、杏仁、芝麻醬、火腿、五花肉、甘乳酪等。
甲狀腺功能減退伴發的精神障礙目前尚無有效的方法治療。含卵磷脂食品、神經遞質的前體利他林、難定記憶功能的訓練有一定幫助記憶恢複。早期用維生素B1治療記憶會恢複慢性、器質性疾病造成的記憶障礙。一般恢複很困難假性癡呆的精神源性遺忘，可通過精神治療獲得好轉。