包括食管的畸形、運動失調、炎症和腫瘤。有些無症狀或症狀輕微，對健康影響不大。病因包括食管的炎症、感染、損傷、消化液刺激等誘發的可能性。
食管疾病的種類多種多樣，根據不同的種類，可有不同的並發症。總體來說，如果疾病嚴重，可導致患者出現消化道潰瘍、感染等症狀，需要患者十分注意。
胚胎期食管發育不全而造成。最常見的是上段食管呈盲端，下段食管與氣管相連接，或上段食管與氣管相連接，下段食管為盲管，出生後立即發生氣管吸入現象，呼吸困難，喂奶時發生青紫及嗆咳等，較易診斷。另一種為氣管與食管之間有一條瘺管相連接，出生後易屢發肺炎，哭時因空氣通過瘺管進入胃腸道發生腹脹，較難診斷，治療均需手術糾正畸形。
一、食管蹼或環胚胎發育過程中的殘遺
蹼較薄，為粘膜層和粘膜下層組成，可發生於食管的任何部位。一個或多個，有時引起吞咽困難。環較厚，由粘膜和肌肉組成，發生於食管與胃的交界處，呈狹窄的細腔，無症狀或發生間斷的吞咽困難。X射線鋇餐造影可以發現病變，用食管擴張術治療效果滿意。
二、食管憩室食管壁上的囊狀外突
由食管壁的一層或多層組成，主要發生在三個部位：
1、上食管括約肌的上方，又稱岑克爾氏憩室。
2、下食管括約肌的上方，又稱膈上憩室。此兩種憩室可能由於食管運動失調造成。
3、食管中點附近，稱牽引憩室。原因尚不肯定，可能為食管壁外的炎症引起食管壁的反應，造成瘢痕牽引而成。岑克爾氏憩室可滯留大量液體，於夜間平臥時可有大量反流。牽引憩室常無症狀。偶而因食物滯留產生吞咽困難。診斷依靠X射線鋇餐造影，對症狀明顯的病列可考慮手術治療。
三、另一種稱壁內憩室
X射線鋇餐造影可見食管壁有很多小憩室，病理檢查為擴張的粘膜下腺管，所以又稱假憩室病。症狀為吞咽困難。可用食管擴張術進行治療。
食管腫瘤良性腫瘤中肌瘤最多見，很少引起症狀，常為偶然發現，除懷疑為惡性者外，不需治療。脂肪瘤或纖維血管性息肉可發生長蒂和無限增大，突入咽喉部可引起窒息。鱗狀細胞乳頭狀瘤可為多發性，可用內鏡摘除。淋巴管瘤、上皮食管囊腫、炎性假瘤或炎性纖維息肉多無症狀，不需治療。
四、惡性腫瘤通常為下述三類
1、食管癌。
2、黑素瘤。表麵息肉樣，瘤上可見有灰色區，活組織檢查常對診斷無幫助，長期預後不良，本病少見。
3、嗜銀細胞瘤。少見，患者多短期內死亡。
為預防消化係統疾病的發生，建議患者應該注意日常的飲食廣大朋友應在日常的飲食中多吃些水果、蔬菜等清淡食物，減少油膩食物的攝入，同時注意避免辛辣刺激食物
胚胎期食管發育不全而造成。最常見的是上段食管呈盲端，下段食管與氣管相連接，或上段食管與氣管相連接，下段食管為盲管，出生後立即發生氣管吸入現象，呼吸困難，喂奶時發生青紫及嗆咳等，較易診斷。應該進行食管鏡的檢查來確定。
食管疾病應根據食管疾病的種類，患者的飲食方案也各不相同，建議患者應該根據醫生建議進行進食，以幫助疾病得到更快的康複。
診斷明確後，可先采用內科治療以緩解反流症狀。包括抬高床頭，避免增加腹壓，減輕體重，低脂飲食。忌煙、酒、睡前飽餐，應用胃腸動力藥如西沙比利，抑酸藥如西咪替丁等措施，內科治療無效，症狀頑固而嚴重，出現嚴重並發症者，應考慮外科手術治療。常用方法包括，修複食管裂孔加食管賁門固定術，胃固定加胃底前固定術，高選擇性迷走神經切斷術等。