1.單純隱性顱裂
一般無需治療，合並膨出者均需手術治療。手術時間最好在出生後6～12個月為宜。目的是切除膨出囊，還納膨出的組織等內容物，修補不同層次的裂孔。根據需要有的需二期手術以整形。一般均應手術治療，但有大量腦組織突到囊內、腫塊巨大者屬禁忌。囊壁將破、尚未發生腦膜炎者，應緊急手術。
2.若巨型腦膜腦膨出或腦膜腦室膨出
畸形及智力低下問題，故無需手術治療。枕部膨出，可在生後6～12個月內手術，多餘腦組織可以切除，顱骨缺損用骨膜翻轉縫合修補，皮膚切除不可過多，防止縫合時有張力。
3.若合並腦積水
可先治療腦積水。鼻根部膨出可在1周歲後手術，采用顱內入路的方法，突出的腦組織予以切除，顱骨缺損處用術前備好的有機玻璃片或鈦片充填，然後覆蓋筋膜片縫合固定，鼻根部皮膚必要時可再次作整形手術。亦可經顱外手術。眶部膨出者可經顳下部入路進行修補。
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