一、發病原因
HGV病毒在宿主細胞體內經過複製而繁殖。
HGV是單股正鏈RNA病毒，基因全長9.4kb左右，擁有一個大的連續，循環中的HGV可能由宿主的脂蛋白覆蓋，表麵有糖分子，所以觀察到的病毒密度較低。
體內外實驗表明，HGV為嗜肝性病毒，在肝細胞內複製，所以肝組織和細胞中能檢測到病毒的基因組RNA和負鏈RNA，是病毒複製位點;在血清和淋巴細胞中隻檢測到基因組RNA，未檢測到負鏈RNA，所以認為並無複製中間體，而HCV是能在淋巴細胞中複製的。HGV感染方式與HCV一致，但其感染力較HCV為低。
二、發病機製
關於HGV的致病性問題，目前尚有爭議。一些學者認為它並不致病，某些HGV標誌陽性者有肝炎表現，可能是由另一種與HGV伴隨存在的未知肝炎病毒所致，其理由如下：
1.HGV基因組無核心區，提示是一種有缺陷的病毒;
2. 兩隻黑猩猩感染HGV後，曾追蹤觀察6年零3個月，其血清HGV持續陽性，說明發生HGV的持續性感染，但一直未出現肝炎，血清丙氨酸轉氨酶正常，肝組織學也未見炎症改變;
3.多數HGV攜帶者的血清丙氨酸轉氨酶正常;
4. 乙肝和丙肝病人合並感染HGV後，病情並不加重，其血清丙氨酸轉氨酶水平與單獨感染乙肝或丙肝病毒者無顯著差異。但一些學者則認為庚肝病毒感染可引起急性和慢性肝炎，還可能與急性重型肝炎有關。
