1.腫瘤標誌物檢查
神經內分泌腫瘤有一種非常重要的腫瘤標誌物，叫做嗜鉻素A（ChromograninA，CgA），它是目前最有價值的神經內分泌腫瘤的通用標誌物（無論是功能性還是非功能性神經內分泌腫瘤）。通過檢測血清或血漿嗜鉻素A水平可以提示患者是否罹患神經內分泌腫瘤，或者跟蹤患者的治療反應，甚至評估患者的預後。血清或血漿嗜鉻素A檢測的診斷敏感性和特異性在60%～95%之間。除了嗜鉻素A這種通用腫瘤標誌物，功能性神經內分泌腫瘤還可以通過檢測其分泌的特殊激素來提示診斷，例如胃泌素瘤可以檢測血清胃泌素水平，胰島素瘤可以檢測血清胰島素水平。
2.影像學檢查
各種影像學檢查，包括內鏡、超聲內鏡、超聲、CT、PET-CT、MRI、生長抑素受體顯像（Somatostatinreceptorscinigraphy，SRS）等是對神經內分泌腫瘤進行定位診斷的重要手段。
3.病理學檢查
神經內分泌腫瘤最終的診斷需要依靠病理學檢查。\n神經內分泌腫瘤病理診斷要點包括：首先通過對神經內分泌標誌物突觸素（Synaptophysin，Syn）和嗜鉻素A的免疫染色確定腫瘤是否為神經內分泌腫瘤，其次根據腫瘤的增殖活性明確腫瘤的分級。腫瘤的增殖活性通過核分裂象數或Ki-67陽性指數進行評估。\n按照腫瘤的增殖活性將胃腸胰神經內分泌腫瘤分級為：G1（低級別，核分裂象數1/10高倍視野或Ki～67指數≤2%）、G2（中級別，核分裂象數2～20/10高倍視野或Ki-67指數3%～20%）、G3（高級別，核分裂象數>20/10高倍視野或Ki-67指數>20%）。在上述基礎上，\n胃腸胰神經內分泌腫瘤病理分類如下：\n（1）神經內分泌瘤（NET） 是高分化神經內分泌腫瘤，分級為G1和G2。\n（2）神經內分泌癌（NEC） 是低分化高度惡性腫瘤，分級為G3。\n（3）混合性腺神經內分泌癌（mixedadenoendocrinecarcinoma，MANEC） 是一種特殊類型的神經內分泌癌，形態學上包括腺癌和神經內分泌癌兩種成分，兩種成分的任何一種至少占30%。
