(一)發病原因
可以引起屈光參差的因素主要包括：①發育因素：在眼的發育過程中，遠視的度數在不斷減輕，而近視的度數在不斷發展，如果兩眼的發展進度不同，就可能引起屈光參差;②雙眼視功能的異常：屈光參差經常發生於斜視之後，主要是由於斜視影響或者說破壞了眼球正視化的過程，打斷了雙眼視功能的發育;③外傷和其他疾病亦可引起屈光參差：上瞼下垂患者屈光參差的發病率大約為55%，其他如眼瞼血管瘤，視網膜病變(玻璃體積血等)，核性白內障等;④手術因素：一些手術可造成人為的屈光參差，如人工晶體的植入，角膜移植，RK術等。
按照其發病病因可以進行如下分類：遺傳性(hereditary)，包括先天性青光眼，先天性白內障和一些導致眼瞼閉合的疾病，如先天性動眼神經麻痹，上瞼下垂等;獲得性(acquired)，包括外傷性，球內或球周占位性病變以及醫源性因素，如單眼晶狀體摘除後的無晶狀體眼，屈光手術，穿透性角膜移植等。
(二)發病機製
一般認為屈光參差的發展有遺傳因素的影響，但其確切機製尚不明了。
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