一、物質代謝的改變
肝功能不全時，代謝的變化是多方麵的，包括蛋白質、脂質、糖、維生素等。而且能反映在血液內血漿蛋白、膽固醇和血糖含量的變化。
(一)蛋白質代謝變化
主要表現為血漿蛋白的含量改變。
(二)血漿膽固醇含量變化
1.單純膽道阻塞，膽固醇排出受阻，血漿膽固醇總量明顯增高，而膽固醇酯占膽固醇總量的百分比正常。
2.肝細胞受損害，膽固醇酯生成減少，血漿膽固醇酯含量減少，在膽固醇總量中所占的百分比降低，血漿膽固醇總量降低或在正常範圍內。
3.肝細胞受損害同時伴有膽道阻塞(如黃疸型肝炎伴有小膽管阻塞),血漿膽固醇總量可以增高，但膽固醇酯在膽固醇總量中的百分比降低。
(三)血糖的變化
二、血清酶的改變
肝髒是物質代謝最活躍的器官，酶的含量極為豐富。肝細胞受損或肝功能障礙時，也可反映到血清中某些酶的改變，有的升高，有的降低。臨床上常利用血清中某些酶的變動來衡量肝髒功能，了解肝細胞的損害程度或膽道係統的阻塞情況。
(一)有些血清酶升高
(二)有些血清酶降低
三、生物轉化和排泄功能的變化
(一)解毒功能降低
(二)對激素的滅能作用低
(三)排泄功能降低
四、肝性腦病(肝性昏迷)
大部分的肝髒疾病都會有黃疸的症狀，這是由於肝髒無法繼續將膽紅素排出所以就在體內累積。(在代謝和有多項職能發揮著主要作用，包括糖原貯存，分解紅血球， 血漿蛋白的合成和去毒。) 當病人出現穀丙轉氨酶升高時，說明其肝細胞已有實質性損傷，使用肝毒性較大的藥物，有可能加重肝損傷。當肝功能不全時，藥物代謝必然受到影響，藥物的生物轉化減慢，血中遊離型藥物增多，從而影響藥物的使用效果並增加毒性。
肝功能不全從狹義上說是指肝病終末期表現出的極為嚴重的代謝紊亂，病人可出現黃疸、腹水等一係列臨床綜合征。其實，目前藥品說明書上講的肝功能不全，泛指的是肝功能不正常，即肝病患者出現的轉氨酶、膽紅素升高等症狀。
肝髒是許多藥物代謝的主要場所，藥物進入人體後，一般要通過肝髒、腎髒代謝轉化、排泄清除。因此，必須減少用藥劑量及用藥次數，特別是使用肝毒性的藥物時更需慎重。
