睡眠障礙的病因並不明晰，目前認為主要的“睡眠調節中樞”位於下丘腦腹前區，即視交叉上核，該區病變除導致睡眠-覺醒周期紊亂外，還可導致體溫及進食活動的改變。
醫學上對睡眠的探討，始於尋找“睡眠中樞”，位於下丘腦或第三腦室側壁的病變能夠產生持久的昏睡，但非生理性睡眠，亦不能解釋醒-睡周期。當前認為和睡眠有關的解剖部位相當廣泛，至少包括額葉底部、眶部皮質。視交叉上核、中腦蓋部巨細胞區、藍斑、縫際核、延髓網狀結構抑製區，以及上行網狀係統等。
牽涉的遞質包括乙酰膽堿、多巴胺、去甲腎上腺素、腺苷、γ-氨基丁酸、5-羥色胺，以及神經肽類如S因子、δ睡眠導致肽(DSIP)等。例如，視交叉上核及其相關聯的視網膜-下丘腦束，具有自身節律性活動功能，在動物中為醒-睡周期的起步點，在人類可能為複雜的起步機構的一部分。又如縫際核含有5-羥色胺能神經元，破壞腦橋的縫際核可以抑製REM的發生，同時破壞中腦的縫際核則SWS消失；藍斑和藍斑下區含有去甲腎上腺能神經元，在覺醒和REM中放電頻率增加，而SWS中則減少。破壞藍斑和藍斑下區也可使REM消失。神經肽中S因子和DSIP已可濃縮成藥劑，注射後能產生SWS。
睡眠障礙可以是某些疾病的並發症狀，失眠也可能導致機體的生理活動發生一係列改變，對機體其他係統的功能亦有影響。長期缺睡可以引致許多神經、精神及亞健康症狀。如煩躁、抑鬱、警覺和活動能力下降，自主神經功能紊亂、消化功能障礙等；甚至會降低免疫機能，影響身體健康及工作效率，使生活質量下降。反之，軀體功能障礙可以是睡眠障礙的誘因，也可能是睡眠障礙的並發症。
睡眠障礙的主要包括失眠症、嗜睡、深眠等睡眠障礙，根據不同的病症其具體表現如下：
一、失眠症
失眠症或稱之為入睡和保持睡眠的障礙，這是最為普遍的睡眠障礙，業已確定，失眠症有三種不同的類型，都有慢性睡眠障礙和白天倦怠的主訴。
1、入睡障礙性失眠，指入睡困難。
2、保持睡眠障礙性失眠，以頻繁的夜間易醒為特征。
3、終末性失眠，指清晨早醒，而且不能再度入睡，這些類型可單獨發生，亦可合並出現，但在環境允許睡眠的情況下出現通宵失眠者比較少見。
二、過度嗜睡性障礙
其中最常見的是發作性睡病，其典型症狀是：睡眠發作；猝倒；睡眠麻痹或稱睡癱；入睡前幻覺。
過度嗜睡性障礙的另一常見類型是睡眠呼吸暫停，係患者在熟睡中反複出現呼吸停頓，並突然驚醒以恢複呼吸，此類睡眠障礙的特征是患者早晨醒來感到精神不振和昏昏欲睡，亦可視其為入睡或保持睡眠的障礙，凡主訴失眠以及白天明顯嗜睡的患者，有睡眠呼吸暫停存在的可能。
三、睡眠-覺醒時間程序的障礙
該項包括高速飛行時引起的暫時性生理節奏紊亂和上班時間更改引起的暫時性睡眠障礙，一種較為持久的症狀是睡眠相延遲綜合征，即長期不能在期望的時間入睡，具有此種症狀的人，在不需要嚴格遵守時間程序時，如周末或假日中卻能安睡，看來睡眠的起始和長度受種屬特異性生物節律的影響，當這些節律不同步時，便出現睡眠障礙。
四、深眠狀態
這指一些出現在慢波睡眠即大多在睡眠Ⅲ，Ⅳ期間的臨床表現，但其睡眠過程本身並無異常，其中之一是夢遊症，多見於兒童及成人的癔症患者，夢遊常發生於睡眠Ⅲ，Ⅳ期中，即患者在夜間睡過一段時間後，會從床上坐起，甚或離床而四處走動，行為較呆板，意識恍惚，問之不答或呼之不應，走動一陣後又睡，次日不能回憶，兒童的夢遊症一般會隨著年齡的增長而自然消失，其他這類睡眠障礙還包括睡中驚恐，遺尿和夜間磨牙，兒童中比較普遍的夜驚約在睡眠一小時後出現，其特征是突然尖叫，成人的夜驚是夢魘，可以使人驚醒，好似感覺到胸部被什麼東西壓住一樣，此種情況都發生在睡眠Ⅳ期中，如果夢魘不醒，常常沒有夢境的回憶，遺尿亦多半出現在夜間睡眠前1/3階段的Ⅲ，Ⅳ期中。
為明確診斷睡眠障礙，臨床醫生必須具有高素質，詳細詢問病史，進行仔細的體格檢查，並借助於必要的輔助檢查。
1、必須熟悉各年齡段個體的正常睡眠周期，在嬰兒期，一晝夜大致可分為3個期，即清醒期，NREM睡眠和REM睡眠；幼年期的睡眠則為間歇性；青少年的睡眠則變得很有規律：入睡後很少醒轉，睡眠潛伏期短，夜間睡眠質量高，在青少年這種正常的睡眠模式中，δ波睡眠出現頻率最高，在前半夜的睡眠中約每45～90分鍾出現1次。
2、成年人睡眠質量和時間均可有下降，睡眠後醒轉次數增加，老年中，δ波睡眠可完全缺失，睡眠時間縮短，睡眠的堅實性喪失，入睡後醒轉次數更多，但白天卻有更多的小睡以補充足夠的全天睡眠時間。
多相睡眠圖記錄能精確確定非特異性的臨床症狀來自何處，一般情況下，完整的NPSG研究比日間小睡研究更有參考價值，在總結NPSG研究的資料時，應歸納總臥床時間，總睡眠時間，睡眠潛伏期以確定睡眠的有效性，應具備REM睡眠，δ波睡眠的記錄，亦應常規記錄活動，警覺，清醒，呼吸暫停，換氣不足，睡眠潛伏期和REM潛伏期。
據世界衛生組織調查，27％的人有睡眠問題國際精神衛生組織主辦的全球睡眠和健康計劃於2001年發起了一項全球性的活動——將每年的3月21日，即春季的第一天定為“世界睡眠日”2004年世界睡眠日的主題是“關注睡眠健康”
產生睡眠問題的原因很多，如某種睡眠障礙、軀體疾病、情感因素、生活方式(過多飲用咖啡和茶葉)以及環境因素(噪聲、擁擠或汙染)等等隻要找出問題所在，就有可能找到辦法來預防，從而重新建立規律的睡眠
睡眠障礙的常規檢查及輔助檢查包括如下：
1、了解睡眠障礙的最重要方法是應用腦電圖多導聯描記裝置進行全夜睡眠過程的監測，因為睡眠不安和白天嗜睡的主訴有各種不同的原因，而腦電圖多導聯描記對於準確診斷是必不可少的。
2、各種量表測定如Epworth睡眠量表(ESS)；夜間多相睡眠圖(NPSG)記錄；多相睡眠潛伏期測定(MSLT)等。NPSG最適用於評價內源性睡眠障礙如阻塞性睡眠呼吸暫停綜合征和周期性腿動或經常性深睡狀態如REM行為紊亂或夜間頭動，對於失眠尤其是入睡困難為主的失眠的評價則無裨益。MSLT常在NPSG後進行，用於評價睡眠過度，該法常可發現發作性睡病中的日間過度睡眠和入睡初期的REM期，MSLT應該在患者正常的清醒周期中進行，並隨後觀察一個正常的夜間睡眠。
在詢問病史和重點神經係統查體基礎上，其他必要的有選擇性的輔助檢查項目包括：
3、CT及MRI等檢查。
4、血常規、血電解質、血糖、尿素氮。
5、心電圖、腹部B超、胸透。
睡眠障礙的具體飲食建議需要根據症狀谘詢醫生，合理膳食，保證營養全麵而均衡。
1、飲食宜清淡為主，戒除煙酒、咖啡，忌辛辣刺激性食物。
2、可以每天睡前喝一溫熱的牛奶。
1、治療
不同類型的睡眠障礙，應施用不同的治療方法。如睡眠呼吸暫停多見於肥胖、高血壓和任何原因造成的上呼吸道狹窄的患者。美國的臨床學家認為，對嚴重睡眠呼吸暫停的最有效治療是氣管造口術。治療失眠症最常用的方法是應用安眠藥。
值得注意的是，安眠類藥物中有的易成癮，有的與酒同服時有危險。長期應用會產生耐藥性，需較大劑量才能入睡。此外，長期應用安眠藥本身能產生睡眠障礙。故失眠患者應當在醫生指導下做到盡可能地合理應用安眠藥物。
2、預後
睡眠是人的生理需要，人一生中有1/3的時間是在睡眠中度過，實驗發現，持續性剝奪睡眠的動物數周後將會死亡，而不管其飼養狀態如何。盡管人類被剝奪睡眠後是否死亡還不清楚，但出現一些與失眠不同的症狀已被公認。
當人被剝奪睡眠60～200h時，將導致睡眠增加、疲勞、易激惹、精力難於集中，熟練的運動功能喪失，自我照顧能力和判斷能力下降，工作能力衰竭；睡眠被繼續剝奪時，將出現頻繁的短促睡眠(microsleep)，各種錯誤不斷出現，最終會出現定向力障礙、錯幻覺、妄想以及意識障礙。神經係統體征包括短暫的眼球震顫、眼球快速運動障礙、手部震顫、眼瞼下垂、麵部無表情、言語遲鈍、錯語。EEG顯示α活動下降，閉眼時α波不再出現，癲癇閾值下降，或癲癇發作。血液中17-OH和兒茶酚胺濃度增加。部分人在持續睡眠剝奪後可出現精神障礙。但不全睡眠剝奪則表現不同，如某些被持續性阻斷REM睡眠的個體可表現為與REM-睡眠剝奪的動物相似的活動增多、情感旺盛、性功能增加等。其機製尚不明了。
應用安眠藥治療失眠症通常有效，但睡眠障礙可以是某些疾病的並發症狀，故其預後各不相同。