肛門膿腫的發病原因有以下：
1.肛門腺感染。肛門腺開口於肛管直腸交界處的肛竇內，肛竇呈漏鬥狀向上開口，易損傷及細菌的侵入而引起感染。肛竇一旦感染後，會引起感染化膿，炎症向肛周的間隙內擴散，因為肛周間隙抵禦細菌感染的能力差，感染易於在這些間隙中擴散，形成不同部位的膿腫。
2、全身抵抗力減弱。如糖尿病、年老體弱、過度疲勞、以及結核患者和艾滋病患者的抵抗力下降，容易發生肛周膿腫，直腸癌患者也可發生肛周膿腫。
3、肛門局部刺激和損傷。如經常吃辣椒、飲酒等刺激性飲食會導致肛管直腸局部充血、抵抗力下降而誘發感染。另外，幹硬的糞塊擦傷肛管皮膚黏膜，腹瀉患者的稀糞落在肛竇內導致肛門腺阻塞，以及肛門直腸外傷或隨飲食咽下的雞、鴨、魚骨刺傷肛管直腸等，都可以導致肛門直腸周圍發生感染而發展成為肛周膿腫。
第二，也可根據影響肛周膿腫的因素進行分析：
(一)感染性因素：現代醫學認為，感染是引起本病的主要原因。
(二)醫源性因素：臨床上屬醫源性引起的肛門直腸周圍膿腫也不少見。
(三)手術後因素：臨床上亦可見到肛門直腸手術引起感染，而形成的直腸周圍膿腫，以及尿道術後感染、會陰部術後感染、產後會陰破裂縫合後感染、尾骶骨骨髓炎術後感染等引起的膿腫。
(四)其它：如槍、刀傷，直腸內異物損傷後感染，性病淋巴肉芽腫，放線菌病，直腸憩室炎感染，肛管直腸惡變破潰或波及深部的感染，及身體虛弱，抵抗力低下，或患有慢性消耗性疾病，或營養不良，都是肛門直腸周圍膿腫的發病原因。
1、肛門失禁：任由肛瘺發展，可對括約肌造成嚴重損傷，甚至可能造成肛門失禁等並發症。
2、病變危險：肛瘺的多發性，可形成直腸陰道瘺、直腸尿道瘺和直腸膀胱瘺，危及周圍髒器，並且多年未治或誤治的老肛瘺有病變的可能。
3、肛瘺：瘺口、瘺管增加：肛瘺的多次反複發作，膿液可穿破管壁順括約肌間隙蔓延而成多發性、複雜性肛瘺，不但給治療帶來困難，而且也影響到肛門的生理功能。
4、感染流膿：肛瘺一旦形成，自愈的機會極少，並帶來一係列的危害。首先肛瘺感染發炎後，肛門疼痛劇烈，潰破後膿水汙染內褲，膿汁刺激局部皮膚，肛門瘙癢劇烈。
1、硬結腫塊：初期肛旁突起一硬結腫塊逐漸增大，時間長了有的可自行破潰。
2、疼痛：為肛周膿腫最常見的症狀，為逐漸加重的持續性腫痛或跳痛，行走不便，端坐受限。
3、發熱：炎症局部紅腫伴有發熱，常為低熱有時出現高熱。體溫可在37-40℃之間。此外，可有全身倦怠不適，食欲不振，睡眠欠佳等。
對於肛周膿腫，很多人都苦不堪言，難纏的肛周膿腫，時輕時重，就這樣反反複複的折磨著每一位患者南寧肛泰肛腸醫院肛腸專家指出，肛周膿腫對人體有很大的傷害，久治不愈會並發肛瘺，但是如果大家在平時能采取適當的措施，就能夠防止肛周膿腫的發生，或減輕膿腫的嚴重程度
1、調理排便：無論排便秘結與否，腹瀉頻作，均可導致肛隱窩炎，引起肛門直腸周圍膿腫大便秘結時，貯於直腸內的糞便易堵塞肛隱窩，引起肛隱窩炎，形成肛門直腸周圍膿腫同時，大便幹結，擦傷肛管皮膚或肛隱窩，也會引起肛門直腸周圍膿腫而腹瀉日久，可使稀便進入肛隱窩，刺激肛隱窩發炎，從而誘發感染
2、養成良好的衛生習慣：養成每日便後洗潔局部的習慣，防止感染
3、飲食適當調理：飲食不可過分精細，不食刺激性強的食物，這樣有利於大便的排泄
4、積極治療肛隱窩炎和肛乳頭炎：采用坐浴、藥栓納肛、口服抗生素或中醫中藥療法，防治炎症深入，甚至化膿而成肛門直腸周圍膿腫
5、積極治療全身疾病：對腸結核、克隆氏病、潰瘍性大腸炎等全身疾病要積極治療
6、鍛煉身體、增強體質：久坐久站的人肛門局部血液循環易發生障礙，降低了局部的抗病能力，容易發生感染所以，久坐之人要積極參加體育運動，增加肛門部的抗病能力[1]
7、不要久坐濕地：在草地、濕土上久坐，肛門部受涼受濕，降低了抗病能力，寒濕之邪容易侵入肛門，引起感染
(1) 壓迫排膿法：即用雙葉肛門鏡或擴張器暴露膿腫部位的肛隱窩，然後壓迫膿腫，仔細觀察膿液排出的部位，即內口所在。該法是確定原發病灶的最簡便可靠手段。
(2) 雙合診法：用食指插入肛管，拇指在皮膚，觸摸膿腫波動最明顯，皮膚及粘膜最薄區，即是內口及外口的位置。
(3) 肛門鏡檢查：一般原發病灶處有隱窩炎，局部充血明顯，隱窩加深形成凹陷，可見有膿性分泌物或肛乳頭炎。
(4) 探針檢查：一般采用有鉤圓頭探針，在雙葉肛門鏡下探查膿腫部位的肛隱窩，感染隱窩多凹陷加深，探針進入容易，如有膿液溢出即是內口。也可切開膿腫後由膿腔內探查，用食指在肛管內觸模，探針頭下最薄，隻隔一層粘膜處，即是內口。但要切忌盲目亂戳，人為造成假內口，使手術失敗。
患有肛周膿腫吃水果一定要有選擇性，應該選擇像西瓜、蘋果、菠蘿、橘子、梨等。因為它們都有潤腸通便的作用。
多纖維蔬菜。如：菠菜、芹菜、冬瓜、絲瓜、南瓜、綠豆、黃豆、油菜、黃花菜、木耳、海帶、蘿卜，還有茭白等蔬菜很清淡，還含有較多的纖維素，能夠清熱解毒，經常使用這些蔬菜，能夠緩解肛門局部腫痛以及流膿流水的症狀。
肛周膿腫的患者，應該忌吃或少吃的辣的食品，像酒、辣椒、生薑、大蒜、肉桂等等，它們都可以刺激局部發炎，加重肛門直腸周圍膿腫的病情。
服用藥物治療肛周膿腫時，一些藥物和一些飲食是不能同時吃的。如在服用清熱解毒劑時，應該忌吃魚、蝦、羊肉、香菜、韭菜等，竹筍、狗肉、海鮮等發物最好也不要吃。那在服用氣血雙補劑的時候，應該忌吃蘿卜、桃子、李子等，否則的話都會影響藥物的療效。
上述食療方法隻是在患者進行了手術治療後予以配合的治療方法，患者切不可將以上內容作為治療的依據，出現相關症狀後，患者還是應及時到正規專業醫院進行治療。
1、保守治療之藥物治療：藥物治療，相信是很多患者在出現症狀時，最為常用的方法，尤其是針對肛腸疾病患者而言。很多患者認為肛周膿腫不是疾病，吃點藥是可以使疾病得到很好的控製的。所以無論是內服還是外敷，通通的拿來服用。蘇州同濟醫院專家指出，肛周膿腫最有效的方法，往往是手術治療。藥物治療，雖然能夠起到一定的治愈效果，但是出現耽誤治療的情況也是常見的。
2、手術引流方法：該療法是傳統中治療肛周膿腫最常見的方法，一般情況下，先將內口中的膿液清除然後再進行治療。由於步驟繁多，所以無論是在治療成本還是在治療效果上，都不是治療肛周膿腫最佳治療方法。除此之外，該療法還容易因治愈不當，導致術後出現肛門失禁或者是其它後遺症。
3、HCPT微創療法：HCPT微創療法之所以被稱為是治愈肛周膿腫最佳治療方法，主要是由於它特殊的治療理念加上有效的治療方法，使患者在一次性治愈疾病的同時，避免治愈後出現其它並發症。對於肛周膿腫，HCPT微創療法首次將熱能運用到人體組織上，可控性可以保障組織在幹結的時候，不會對其它部位產生影響。肛周膿腫患處在高頻產熱的原理下，快速的治愈患處。通過無數臨床病例顯示，HCPT微創療法安全性強，而且治療效果好，是肛周膿腫患者治愈疾病最有效的方法。