泌尿道真菌感染主要影響膀胱和腎。最常見的病因為念珠菌種，其為人類的正常共生菌，經常從口腔，胃腸道，陰道和損傷的皮膚中找到。然而，所有的致病真菌（如新型隱球菌，曲黴菌種，毛黴菌種，組織胞漿菌，芽生菌，球孢子菌）可作為全身性或播散性真菌感染的一部分感染腎髒。
念珠菌下尿路感染主要是因為局部尿路導尿管。一般，雖然念珠菌和細菌感染經常同時發生，但大多數Foley導尿管有關真菌感染隨著菌尿及抗生素治療後。
腎念珠菌病通常是血源性播散，常從胃腸道起源。從腎造口術的導管上行感染，其他長期留置物，支架亦會發生。高危病人是那些患腫瘤，艾滋病，化療或用免疫抑製藥物後免疫功能受損者。這類病人中念珠菌血症的主要院內感染來源是血管內留置導管。腎移植增加了真菌感染的危險性，因為其有留置導尿管，支架，抗生素，吻合漏，梗阻和免疫抑製治療。
腎盂腎炎又稱上尿路感染，一般伴下泌尿道炎症，急性腎盂腎炎多發生於生育年齡的女性，病人常有腰痛、腎區壓痛、叩痛、伴寒戰、發熱，頭痛、惡心嘔吐等全身症狀，以及尿頻尿急和尿痛等膀胱刺激征，驗血可見白細胞增高。一般無高血壓或氮質血症。病人尿液混濁，可有肉眼血尿，尿常規鏡檢有多量白細胞或膿細胞，可有少許紅細胞及管型，蛋白少許至中等量。
1、膀胱炎：急性膀胱炎常突然起病，排尿時尿道有燒灼痛，尿頻，往往伴尿急，嚴重時類似尿失禁，尿頻尿急常特別明顯，每小時可達5～6次以上，每次尿量不多，甚至隻有幾滴，排尿終末可有下腹部疼痛。尿液混濁，有時出現血尿，常在終末期明顯。恥骨上膀胱區有輕度壓痛。部分患者可見輕度腰痛。炎症病變局限於膀胱粘膜時，常無發熱及血中白細胞增多，全身症狀輕微，部分病人有疲乏感。
2、輸尿管梗阻：表現為UPJ處動力性功能失調。其特點為UPJ無明顯的腔內狹窄及腔外壓迫因素，逆行尿路造影時輸尿管導管能順利通過，但卻有明顯的腎積水。
出現不能解釋的念珠菌尿時應及時評價有無尿路結構異常，已證實有念珠菌尿的病人臨床可表現為無症狀性念珠菌尿，尿道炎和前列腺炎、膀胱炎（伴或不伴糞石形成或氣體形成），原發性腎念珠菌病和血源播散性念珠菌病。
與細菌性尿路感染不同，念珠菌尿水平反映了真正的念珠菌性尿路感染，及不僅是導尿管內集落或尿液標本的汙染並不知道，通常在出現膀胱炎或刺激和念珠菌尿的高危病人中診斷膀胱炎。來自真菌的物質排出有時可被觀察到，膀胱鏡和腎髒，膀胱超聲有助於發現糞石形成和梗阻。
存在發熱和念珠菌尿，有時存在乳頭壞死和真菌球排出提示上行性腎念珠菌病的診斷，盡管腎功能常常減退，如無腎後梗阻時嚴重腎衰很少發生。尿路影像能幫助評價受累程度。念珠菌血培養常為陰性。
真菌尿路感染，多見於育齡期女性，注意外陰的清潔衛生很重要尿路感染多有一定的誘因，故應仔細檢查患者有無尿路結石，腎或輸尿管有無畸形等情況除藥物治療外，多喝水，保持每天尿量在2000ml以上，這樣起到尿路衝洗的作用，對於尿路感染的治療也很重要應用中醫中藥治療尿路感染已積累了大量的臨床經驗，可以應用如清熱解毒的板蘭根、地丁、敗醬草、車前草等，此外，還應注意加強營養，增強體質
1、肋腰點壓痛，腎區叩擊痛。
2、尿常規檢查，尿中白細胞增多，膿尿。
3、尿沉渣塗片染色，找到細菌。
4、尿細菌培養找到細菌。
5、尿菌落計數＞10的5次方／ml，有尿頻等症狀者，＞10的2次方／ml也有意義；球菌10的3次方-10的4次方／ml也有診斷意義。
6、一小時尿沉渣計數白細胞》20萬個。
7、血常規示白細胞升高，中性粒細胞核左移。
宜吃流質或半流質食物及水果發燒病人的飲食應清淡、易消化，並含有豐富的維生素，一般以流質或半流質食物為主，如米湯、稀飯、麵條、藕粉等，並搭配一些新鮮水果。退燒後，可以食用清雞湯麵、菜泥粥等食物。到病情恢複後期可以多補充瘦肉、魚、豆腐等高蛋白食物。
念珠菌尿對於氟胞嘧啶每日50~150mg/kg每6小時1次口服治療1~2周有效，但常常出現抵抗。在新的抗真菌衍生物中氟康唑似乎對於真菌性尿路感染最有效，因為其口服生物利用度高，每日一次劑量，進入尿和腦脊液穿透力良好。氟胞嘧啶或氟康唑200mg/d口服應給予無症狀性念珠菌尿病人。
未留置導尿管的症狀性膀胱炎患者可以氟胞嘧啶或氟康唑治療1~4周。單劑量的兩性黴素B0.3mg/kg靜注也有很好的療效。當長期留置導尿管時，氟胞嘧啶和氟康唑可減少真菌尿，但很少能根除。膀胱衝洗可能有效。
在患腎念珠菌病的病人中，以兩性黴素B和大劑量氟康唑（≥400mg/d）治療與白色念珠菌和熱帶假絲酵母菌的侵襲性感染初期治療同樣有效。甚至在開始時應用兩性黴素B，口服氟康唑亦應在治療早期取代之。然而，一些少見念珠菌種對於氟康唑不敏感。