重複尿道的真正原因尚不十分明確，有多種學說，但每種學說也不能解釋所有類型的發生原因，主要學說有如下幾種。
一、Das（1977）認為，在胚胎尿道發育過程中，陰莖及尿道板發育互相不平衡、不協調，而發生了以下3種情況。
1、尿生殖竇的陰莖已發育，而尿道脊發育遲緩。因陰莖已經發育，尿生殖竇也隨著陰莖向前發育，即形成了副尿道。當副尿道形成後，尿道脊才開始發育，形成了正尿道。結果成為第Ⅰ型重複尿道。
2、生殖皺襞畸形融合，使尿道交叉，結果形成了第Ⅱ型不完全性重複尿道。
3、午菲管及苗勒管對男女尿道的分化有重要作用。午菲管占優勢，即發展成女性尿道。在尿道發育過程中，若開始時午菲管處於劣勢，尿道即開口於會陰部，繼而午菲管由劣勢又轉為優勢，則尿道隨著陰莖又發育成男性尿道，結果形成了重複尿道。一條尿道開口於會陰部，另一條尿道隨著陰莖而發育，開口於陰莖頭，即第Ⅲ型重複尿道。
二、Wilson認為（1971），尿直腸膈將穴肛分隔為前後兩個腔，前麵發育成膀胱及後尿道，後麵發育成肛門直腸。尿生殖膈止於穴肛膜。若繼續向下發育，則把尿道也分隔成前後兩部分，形成重複尿道，即第Ⅰ型重複尿道。
三、間質從尿道原基的側麵插入，將尿道隔成前後兩個管腔（Tripathi，1969）。
四、胚胎時尿道溝交叉，即形成了重複尿道呈第Ⅱ型（Moog，1968）。
重複尿道常並發其他器官畸形，如腎髒、輸尿管畸形，雙膀胱，雙陰莖（雙陰蒂），子宮發育不全，無陰道，性腺異位，脊柱及腸道畸形等，因此應進行全麵的檢查。其他並發症如尿道憩室，同樣有兩段排尿，但膀胱造影和排尿性膀胱尿道造影可顯示膀胱內無憩室，尿道內有囊性腫塊，尿道鏡檢查顯示憩室開口在尿道而不是在膀胱。
重複尿道臨床表現不盡一致，與其類型有關，最常見的症狀是尿道感染、副尿道尿流不暢。所以副尿道常有感染，由於病灶隱蔽，常是慢性尿路感染的一個病灶。
第Ⅰ型重複尿道的副尿道平滑肌發育不全，約半數病人有尿失禁，輕者發生壓力性尿失禁，重者為完全性尿失禁。第Ⅱ型若副尿道發生炎症，尿道分叉處的黏膜水腫或副尿道內分泌物積聚，可壓迫正尿道發生排尿困難，產生尿道梗阻的症狀。
重複尿道的真正原因尚不十分明確，有多種學說，但每種學說也不能解釋所有類型的發生原因，故本病無法直接預防，早期發現、早期診斷、早期治療對本病的間接預防具有重要意義孕期應做到定期檢查，若孩子有發育異常傾向，經B超明確後，對嚴重患兒可選擇行人工流產，以避免疾病患兒出生
重複尿道通過逆行尿道造影及排尿性膀胱尿道造影可確定副尿道與正尿道的關係，經副尿道口注入亞甲藍，然後排尿，可以確定副尿道與正尿道及膀胱是否溝通。尿道鏡檢查時，由副尿道注入亞甲藍，更易看到副尿道在尿道內開口的位置，用尿道探子，由副尿道口及正尿道口同時探入，亦可探測出它們之間的關係。
重複尿道患者除了常規的治療外，飲食上也要注意以下方麵：飲食注意要以宜清淡為主，多吃蔬菜水果，合理搭配膳食，注意營養充足。
重複尿道的治療需根據病變及體征分別考慮，目的是保持有功能的尿道。第Ⅰ型副尿道無症狀者可不予治療，輕度感染者可用抗生素治療。症狀嚴重者可將副尿道切除或用電凝器燒灼，注入硬化劑使副尿道封閉，但可使陰莖下彎加重，發生陰莖勃起疼痛。
第Ⅱ型副尿道的外口在陰莖頭部者，可將兩個尿道之間的間隔切開，使兩條尿道變成一條。副尿道開口於陰莖者，遠端尿道呈索狀，若有陰莖畸形，需行索狀尿道切除，矯正陰莖下彎。第Ⅱ型副尿道通向會陰部者，可單純切除。通向直腸者可將副尿道切除，行尿道直腸瘺修補。