周期性內斜視發病原因至今不明，主要有以下幾種看法。
1、大腦優勢學說
周期性內斜視可能與大腦優勢的變更有關。表現為患者不特別選用某隻手。這些現象可能表明大腦半球一側的活動並非始終對另一側保持優勢,此種學說未被多數學者證明。
2、融合機製失調學說
認為周期性內斜視大多數患兒都有不同程度的遠視，由於遠視經常需要調節從而相應地增加了輻輳作用，使眼球易向內偏斜所以在出現顯性斜視之前可能就有較大的內隱斜。由於外融合力加以控製，使眼位不發生偏斜。後因某種原因，如精神或心理因素、外界環境及內在疾病等因素破壞了眼位的平衡，使外融合力對內隱斜的控製失調而出現隔日性間歇性或者恒定性內斜視。
3、生物鍾機製學說
不少學者認為周期性內斜視與機體正常“生物鍾”現象障礙有關。
周期性內斜視患者可能會導致視力發育不良而造成弱視，同時術後如果不注意護理，容易並發感染。常有明顯誘因，如發熱、驚嚇、外傷等，開始為周期規律性內斜視，隨後逐漸變為恒定性內斜視。
周期性內斜視的病人因為眼位不正，其注意一個物體時，此物體影像於正常眼落在視網膜中心凹上，斜視眼則落在中心凹以外的位置，如此視物就會出現複視情形。此病的具體臨床表現如下。
一、眼位周期性變化
一般周期為48h，即患眼一天呈現內斜視，一天呈正位，少數表現為72h或96h1個周期，有人報道周期性變化在1個月～1年即消失，轉為恒定性。
二、斜視度
在出現斜視時，多呈大角度內斜視，一般在30°～40°（或40°～50°），且遠近斜視度相等或相近，部分病例可伴有輕度V征。
三、視功能
視力一般正常，斜視時無雙眼單視和立體視，部分病例斜視時可有複視，正位時表現二類不同情況，一類呈現完全正位，此時患者雙眼單視與立體視完全正常，且有生理性複視現象。另一類，患眼並不完全正位，而呈小角度內斜視，但仍為正常視網膜對應。
四、非調節性
周期性內斜視患者的屈光度一般在2.00D左右，戴鏡與否與眼位變化無關，但可獲得融合，AC/A比率可高於正常。
五、眼球運動
眼球運動不受限，但可表現為內直肌亢進。
六、突然發病
常有明顯誘因，如發熱、驚嚇、外傷等，開始為周期規律性內斜視，隨後逐漸變為恒定性內斜視。
七、EMG檢查
有的病例有外直肌EMG異常。
八、其他
周期性內斜視的眼位變化基本規律，但仍有3種變異情況。
1、眼位的周期規律變異：可因情緒等原因而暫時發生紊亂，出現連續2天內斜或連續2天正位的現象，有的病例眼位周期可縮短為24h，甚至12h。
2、正位相與斜位相時間的變異：正位相與斜位相的時間可以相等，也可以不相等，患者眼位變換交替的具體時間，隻在某個階段相對地固定，而過一段時間，同一病人的眼位變換又固定在另一具體時間。
3、斜視度的變異：周期性內斜視患者的斜視角不很穩定，常有變化，在每個斜視日的斜視度可出現不同。非斜視日有時為正位，有時為小角度內斜視。
典型的周期性內斜視具有特異的臨床表現，診斷並不困難，但對已轉變為恒定性內斜者應詳細詢問病史才能有所了解，對變異型者應觀察數日方可診斷。
周期性內斜視發病原因至今不明周期性內斜視可能與大腦優勢的變更有關周期性內斜視無預防，早發現、早診斷是主要防治措施
周期性內斜視的診斷主要是依靠臨床表現，無特殊實驗室檢查，部分病例眼外肌（外直肌）肌電圖異常，通常做眼科檢查和視力驗光。
周期性內斜視除了常規的治療外，飲食上還要注意下列方麵：患者的飲食隻需根據平時的飲食習慣就好，隻是生活問題更需要多加注意。
周期性內斜視為非調節性，戴鏡不能矯正眼位，以手術治療為主。
1、在發病後至少觀察6個月，再行斜視矯正術。
2、手術量應根據斜視日的斜視度計算，無論在斜視日或非斜視日手術，術後不會引起過矯，周期性改變可消失。
3、手術時機原則上變為恒定性斜視後再手術，但有的病例數年以上一直維持周期性，此時應當及早做內直肌減弱術。手術方法大都主張行雙眼內直肌後退術或患眼內直肌後退和外直肌縮短術，常可獲得滿意效果。