埃可和柯薩奇病毒經呼吸道或口腔進入消化道，侵入腸道黏膜，在該處的上皮細胞及腸壁淋巴組織中居留和增殖，在早期也可在咽部淋巴組織停留和增殖，時間較短。病毒可從上述部位經淋巴及血液循環到達全身各器官，引起內髒器官病變。
小兒埃可及柯薩奇病毒感染可引起腦膜腦炎、腦脊髓炎、心肌-心包炎等，可致各髒器功能損害。新生兒患病可發生猝死或慢性充血性心力衰竭，也可發展為慢性心肌炎、心肌病、縮窄性心包炎、心內膜彈力纖維增生症、心肌缺血和梗死。
小兒埃可及柯薩奇病毒感染時，臨床表現極為多樣化，常為多種表現同時存在。
一、神經係統感染
1、腦膜腦炎
一般認為該兩種病毒可引起腦炎及無菌性腦膜炎綜合征。一般發病急，均有發熱，輕重不等，以輕型為多。輕者可無腦膜腦炎的臨床表現及體征，腦脊液檢查異常才被發現。常見症狀和體征有惡心、嘔吐、頭痛、腦膜刺激症狀等。同時伴有咽痛、腹痛、腹瀉等非特異性表現。
2、癱瘓疾病
與脊髓灰質炎相比，該兩種病毒引起癱瘓發生率較低。患者症狀輕、恢複快、預後好。
二、心髒疾病
此兩種病毒可引起心肌-心包炎。新生兒患病可為胎內感染，病情重、預後差，可發生猝死或慢性充血性心力衰竭。心肌-心包炎的輕重程度懸殊，輕者僅有心電圖改變，重者出現麵色蒼白、發紺、咳嗽、呼吸困難、心率增快、心髒擴大、心音低鈍、肺部囉音，肝髒增大等表現。
三、呼吸道感染
埃可及柯薩奇病毒許多型可引起上呼吸道感染，少數引起下呼吸道感染。由於型別不同，同一患兒可多次發生。患兒突然出現發熱、咽痛、頭痛、腹痛。咽部初起充血，繼而出現灰白色皰疹。皰疹破崩，形成黃色潰瘍。
四、發疹性疾病
皮疹出現於其他部位感染時，僅為一種表現。皮疹的形態、數量和分布變化多，可為斑疹、斑丘疹、水皰疹、蕁麻疹、偶見瘀點。皮疹部位不定，一般2～4天消退，不留痕跡。有一種手足口病，主要由柯薩奇病毒A16、A5、A10引起，多見於4歲以內年幼兒。其特點為口腔內見小皰疹或潰瘍，位於舌、頰黏膜及硬齶處，偶見於軟齶、牙齦、扁桃體。
五、腹瀉
腹瀉可見於四季，尤以夏秋季為多。埃可及柯薩奇病毒感染為嬰幼兒腹瀉的常見病因。患兒大便多為黃色或黃綠色稀便，可帶黏液，偶見少量血液。
六、其他疾病
患者尚可見流行性胸痛或肌痛，尚有四肢肌肉酸痛和全身肌痛。疼痛程度不等。輕者感緊壓樣及脹痛，重者似刀割、針刺。胸腹痛時咳嗽及深呼吸時加劇，腹部可有壓痛，甚至出現腹肌痙攣及強直。
小兒埃可及柯薩奇病毒感染目前尚無預防疫苗對於體弱或新生兒有密切接觸史者，可注射丙種球蛋白3～6ml或胎盤球蛋白6～9ml丙種球蛋白與抗生素合並使用，可提高對某些嚴重細菌性和病毒性疾病感染的療效胎球蛋白是一種可以增加人體免疫功能的生物製品，從健康產婦的胎盤中提取由於成人大多發生過麻疹、甲型肝炎的顯性(指發病)或隱性(指不發病)感染，血清中含有相應的抗體，因而胎盤球蛋白可用於某些病毒病的預防
小兒埃可及柯薩奇病毒感染在確診時，除依靠其臨床表現外，還需借助化學檢查。主要的檢查方法有以下幾種：
1、血常規檢查
白細胞多在正常範圍，分類亦無明顯變化。
2、腦脊液檢查
腦膜炎、腦炎患者的腦脊液可呈非化膿性炎症改變，壓力輕度增高，白細胞數輕度增多。
3、病毒分離
用組織培養和動物接種分離病毒，如能從病人血液、腦脊液、心包液、皰疹液及組織中分離到病毒則可作為確診依據。
4、血清學檢查
特異性高的抗體為中和抗體，病後2周開始升高，3周時達高峰，可維持3～6年，故不能用於早期診斷。國內有人用親和素-生物素複合酶-間接免疫組化法(ABC-IPA)可檢測患者血清及腦脊液中的柯薩奇B組病毒IgM抗體，有早期診斷價值。
小兒埃可及柯薩奇病毒感染飲食宜清淡富於營養，注意膳食平衡。忌辛辣刺激食物，以免造成病情反複的情況。多吃新鮮的蔬菜和水果，多食用可提高免疫力的食物，如山藥、烏龜、香菇、獼猴桃、無花果、蘋果、沙丁魚、蜂蜜、牛奶、豬肝等，以提高機體抗病能力。
小兒埃可及柯薩奇病毒感染，目前無特效抗病毒藥物，主要采取對症處理。心包炎時如診斷明確，無需穿刺放液。有顱壓高時用20％甘露醇。心力衰竭用洋地黃類製劑，以快速或中速製劑為宜。
1、對症處理
本病臨床治療以對症處理為主。急性期宜加強護理、注意休息，保持適當進食和水分；吐瀉者要糾正脫水、酸中毒；驚厥和嚴重肌痛者給予鎮靜止痛藥；急性心肌炎伴心衰應快速洋地黃化，並及時供氧；輕癱時注意肢體溫濕敷，並予以相應理療、針灸；對體弱者、嬰幼兒危重者，支持療法不應忽視。
2、抗病毒治療
重症者可考慮使用幹擾素、利巴韋林等核苷類抗病毒藥物。免疫球蛋白中存在多種腸道病毒的中和抗體。高危兒出生後肌注入血丙種球蛋白250mg，可減少發病及減輕病情，也可用靜脈用人血丙種球蛋白(IVIG)，每天400mg/kg，應用3～5天，早期可阻止腸道病毒在患兒體內複製。。