麻疹感染過程中由於體內免疫力低下，很易繼發其他病毒或細菌性感染。
1.呼吸道並發症
(1)肺炎：通常是指肺的急性滲出性炎症，為呼吸係統的多發病、常見病。據世界衛生組織調查，肺炎死亡率占呼吸係統急性感染死亡率的75%。肺炎可由不同的致病因子引起，根據病因可將肺炎分為感染性(如細菌性、病毒性、支原體性、真菌性和寄生蟲性)肺炎，理化性(如放謝性、吸入性的類脂性)肺炎以及變態反應性(如過敏性和風濕性)肺炎。由於致病因子和機體反應性的不同，炎症發生的部位、累及範圍和病變性質也往往不同。炎症發生於肺泡內者稱肺泡性肺炎(大多數肺炎為肺泡性)，累及肺間質者稱間質性肺炎。病變範圍以肺小葉為單位者稱小葉性肺炎，累及肺段者稱節段性肺炎，波及整個或多個大葉者稱大葉性肺炎。按病變性質可分為漿液性、纖維素性、化膿性、出血性、幹酪性、肉芽腫性或機化性肺炎等不同類型。
(2)中耳炎：累及中耳( 包括咽鼓管鼓室 鼓竇及乳突氣房 )全部或部分結構的炎性病變絕大多數為非特異性安排炎症，尤其好發於兒童。可分為非化膿性及化膿性兩大類。非化膿性者包括分泌性中耳炎氣壓損傷性中耳炎;化膿性者有急性和慢性真是之分特異性炎症太少少見如結核性中耳炎等。常見有分泌性中耳炎、急性化膿性中耳炎、及膽脂瘤型中耳炎和氣壓損傷性中耳炎。
為麻疹常見並發症，多發生於年幼病兒，為繼發細菌感染。患兒哭吵不安，注意外耳道有無分泌物流出。
麻疹病毒感染常波及肺部，約一半以上麻疹患者有肺部病變，有麻疹病毒引起的肺炎大多發生在病之早期。患者可有輕度氣促，肺部出現囉音，X線檢查肺門淋巴結增大，肺紋理增粗，兩肺過度充氣，肺小片浸潤，疹退後陰影消失較快。細菌或其他病毒引起的繼發性肺炎為麻疹最常見並發症，多見於出疹期，以嬰幼兒患病為重。臨床上於皮疹出齊後發熱持續不降，氣急缺氧症狀加重，肺部囉音增多，中毒症狀加劇，尚可出現吐瀉、脫水、酸中毒等代謝紊亂，甚至出現昏迷驚厥、心力衰竭等危重症狀。肺部X線片可見大片融合病灶。金黃色葡萄球菌肺炎易並發膿胸、肺膿腫、心包炎等。病程反複遷延不愈，遠期尚可遺留支氣管擴張症。住院麻疹患者中大多並發肺炎，為引起麻疹死亡最主要的原因。
(3)喉炎：麻疹過程輕度喉炎、氣管炎頗為常見，有時發展成嚴重急性喉炎或喉氣管支氣管炎，多屬細菌繼發感染。出現聲音嘶啞、哮吼、頻咳、呼吸困難、缺氧及胸部三凹征等。呼吸道嚴重阻塞時必須及早進行氣管切開或插管，進行搶救。
2.神經係統並發症 腦炎為麻疹較常見的並發症。又稱蘇聯春夏腦炎或稱遠東腦炎，是由森林腦炎病毒經硬蜱媒介所致自然疫源性急性中樞神經係統傳染病。森林腦炎病毒屬於蟲媒病毒乙群，為RNA病毒，可在多種細胞中增殖，耐低溫，而對高溫及消毒劑敏感，野生齧齒動物及鳥類是主要傳染源，林區的幼畜及幼獸也可成為傳染源，傳播途徑主要由於硬蜱叮咬。人群普遍易感，但多數為隱性感染，僅約1%出現症狀，病後免疫力持久。
據統計普種疫苗前發病率在0.01%～0.5%，即使在無明顯神經係統症狀的患者中，腦電圖檢查50%可見異常，大多認為麻疹腦炎多為麻疹病毒直接侵犯腦組織引起，曾多次從腦組織或腦脊液中檢出麻疹病毒或其抗原，但病毒引起的免疫反應在發病機製中的作用尚不能除外。麻疹腦炎大多發生在出疹期，偶見於出疹前或疹退後。
臨床常有高熱、頭痛、嘔吐、嗜睡、神誌不清、驚厥、強直性癱瘓等。腦脊液有單核細胞增多、蛋白質增加、糖不低。大多數患者可痊愈，但少數可留有智力障礙、肢體癱瘓、癲癇、失明、耳聾等後遺症。
3.心血管係統並發症 麻疹出疹期中毒症狀嚴重，高熱、氣促、缺氧、脫水等常導致心功能不全，患者常表現為呼吸急促、麵色蒼白、鼻唇發紺、煩躁不安、四肢厥冷、脈搏細速、心音低鈍、皮疹轉暗或突然隱退，肝急劇增大，病情重危。心電圖見低電壓、T波倒置、傳導異常等。少數患者出現心肌炎或心包炎征象。
4.其他並發症 護理不當、飲食不周、環境陰暗潮濕常使患者發生並發症。長期忌口、忌油引起營養不良、維生素A缺乏等，使全身免疫力下降，嚴重者出現角膜軟化甚至穿孔引起失明。忽視口腔衛生引發口腔炎，甚至發生走馬疳等嚴重並發症。麻疹後可因毛細血管通透性增加引起皮膚紫斑、黏膜出血。繼發感染可引起局部淋巴結炎、化膿性眼結合膜炎、腸炎、闌尾炎、腦膜炎等。麻疹後人體免疫力下降易發生百日咳、白喉等呼吸道傳染病，又容易使原有結核病灶複發、擴散引起粟粒性結核及結核性腦膜炎。
