小兒短指-球狀晶體異位綜合征常並發繼發性青光眼，先天性瞳孔膜殘存，視力明顯減退甚至失明等。
繼發性青光眼：繼發性青光眼是一些眼部疾病和某些全身病在眼部出現的合並症，這類青光眼種類繁多，臨床表現又各有其特點，治療原則亦不盡相同，預後也有很大差異.起病甚急，有典型的霧視、虹視、頭痛、甚至惡心嘔吐等青光眼症狀，症狀消失後，視力、視野大多無損害。檢查時，可見輕度混合充血，角膜水腫，有少許較粗大的灰白色角膜後沉降物，前房不淺，房角開放，房水有輕度混濁，瞳孔稍大
先天性瞳孔膜殘存：先天性瞳孔殘膜又稱永存瞳孔，為胎兒期瞳孔膜的殘留。瞳孔殘膜為胚胎時期晶狀體表麵的血管膜吸收不全的殘跡。胎生時晶狀體被血管膜包圍，到胎生7個月時該膜完全被吸收而消失。但有時在出生後晶狀體前囊上殘存一部分，顏色和虹膜相同，有絲狀及膜狀兩種。一般一端始於虹膜小環，另一端附著在對側的虹膜小環外，或附著於晶狀體前囊。通常不影響視力和瞳孔活動，不需要術後治療。但對於影響視力的厚瞳孔殘膜，可行手術或激光容易治療。
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