一、鑒別：
1、慢性進行性眼肌麻痹 比較少見， 常為遺傳或先天性， 多發生於兒童或成人早期主要表現為， 早期上瞼下垂， 常為兩側性， 繼之眼外肌麻痹， 有時眼內肌也可受侵， 臨床表現很像重症肌無力。但無肌肉異常疲勞現象， 休息後不減輕， 活動後也不加重。
2、腦動脈瘤及顱底腦膜粘連均能引起動眼、滑車及外展神經損害， 故可發生多數眼肌麻痹， 與眼肌型重症肌無力相似， 但這些疾病的發病較急， 常有明顯的頭痛和瞳孔改變， 腦脊液或腦血管造影檢查有相應的改變
3、腦千腫瘤多見於兒童中腦腫瘤 如鬆果體部從外向內壓迫， 則出現兩眼向上運動不能。橋腦腫瘤， 則出現病灶側的麵神經和外展神經麻痹及對側肢體癱瘓。延髓腫瘤， 病灶側出現舌咽迷走神經麻痹及對側肢體癱瘓或舌下神經麻痹及對側肢體癱瘓。以上症狀時可類似重症肌無力。但腦於腫瘤常有排尿， 困難、頭痛/錐體束征，晚期出現顱內壓增高症狀。
4、急性多發性神經根炎常發生麵神經舌咽神經、迷走神經和四肢軟癱， 與重症肌無力相似但其發病較急， 病前常有上呼吸。道感染史， 腦脊液檢查有旦白細胞分離現象， 即蛋白量可顯著增高， 而細胞數無明顯改變。
5、急性有機磷中毒 可出現肌無力及球麻痹症狀， 與重症肌無力相似。但有明顯的中毒病史， 病人表現心率毒病史不清， 僅等。在慢性中毒病例， 有時中毒病史不清， 僅出現肌肉無力及震顫。如檢查血膽鹼酷酶活性降低，即可診斷。有機磷中毒時不能使用新斯的降低即可診斷。有機磷中毒時不能使用新斯的明， 因能加重症狀， 引起不良後果。
6、肌營養不良 緩慢進行性肢體無力，肌萎縮，兒童患者翼狀肩胛，腓腸肌假肥大，血肌酶升高，有家族史。七運動神經元病 早期僅表現舌及肢體肌無力，體征不明顯，鑒別不易，若出現肌萎縮，肌纖維顫動或錐體束征則鑒別不難。
