本病應與下列各種病變鑒別：
1.宮外孕 有月經延遲、急性腹痛及陰道流血。子宮直腸窩觸痛更多發生於宮外孕及盆腔子宮內膜異位症。β-HCG定量試驗達到一定濃度就可明確診斷。雖然約有20%的扭轉病人同時有宮內妊娠，依靠B超掃描顯示宮內胚囊就可鑒別附件扭轉合並宮內妊娠與宮外孕。
2.急性盆腔炎(PID) 腹痛、觸痛一般多為雙側性。急性扭轉的腹痛發作較PID更為突然和劇烈。PID可觸及雙側炎性腫塊，而急性扭轉的腫塊一般為單側，且更呈球狀。PID還具有相關病史：如有PID發作史，性生活紊亂，性伴侶有冶遊史，或最近有放置宮內節育器等宮內手術操作，均可協助診斷。
3.闌尾炎 腹痛一般從上腹部轉移到右下腹部。肛診：附件區無觸痛，盆腔無異常發現;附件扭轉者腹痛急驟，發作時即伴有惡心嘔吐，而闌尾炎出現的惡心嘔吐隨病情進展而逐漸發生，凡主訴右下腹痛而剖腹手術不能明確診斷闌尾炎者，均應探查盆腔髒器有無異常。
4.附件包塊 沒有發生扭轉的附件包塊一般不引起疼痛，除非包塊破裂、扭轉或內出血。
5.卵巢卵泡或黃體破裂 症狀不如扭轉那樣嚴重，如不再出血，症狀可在1～2天內消失。發作時間與月經周期有關，常在月經中期或月經前幾天，很少出現惡心嘔吐。症狀嚴重和持續者盆腔檢查時有子宮直腸窩飽滿和觸痛等體征。
6.腎結石 腹痛呈劇烈陣發性疼痛，向大陰唇放射，但以季肋部、肋脊角或背部叩擊痛顯著，伴有血尿。無腹肌痙攣，無附件包塊觸及。有反複發作的既往病史。靜脈腎盂造影可明確診斷。
7.子宮肌瘤急性變性 較罕見，腹痛較劇，伴有發熱，帶蒂的漿膜下肌瘤容易與本病混淆，通過腹腔鏡或B超檢查能明確鑒別。所幸異病同治，誤診手術對患者絲毫不受影響。
