診斷應注意本綜合征與肌緊張營養不良的區別,後者肌肉萎縮以顳肌最為明顯,病人呈“斧頭”麵容(Hatchet-face),嚴重時下頜肌和頸部肌群可嚴重萎縮,肌緊張反應是二者的最重要鑒別點。還應注意本綜合征與硬皮病、指端硬化症及伴掌皮膚硬化的肢端硬化症相鑒別。根據這些疾病有無毛發變白、過早禿發以及有無沃納綜合征的特征性麵容與體型,比較容易鑒別。
沃納綜合征必須與自然老化仔細鑒別(表1)。另外,還必須與盧斯曼(Rothmund)綜合征,伴有神經肌炎的皮膚性白內障(Andogsky綜合征),伴有發育不全的小兒早老症(Hutchinson綜合征),毛發、指甲營養不良伴有外胚層發育不全(Ellis-van Greveld綜合征),肌強直營養不良(Steinert綜合征)等,加以區別。