真菌檢查有助於皮膚癬菌的鑒定，菌落形態、鏡下特征尤其是大分生孢子的大小、形狀、分隔、胞壁的特點及著生方式，是本病必做的檢查。
組織病理檢查：皮膚癬菌病的多種臨床表現是真菌對角化組織直接損傷(主要是毛發和甲)和宿主炎症反應的結果，後者變化多樣。對紅色毛癬菌的幹燥型感染可見單純的角化過度，而親動物性皮膚癬菌所致的炎症明顯的膿癬則表現為膿皰。以紅色毛癬菌為例，可引起表皮改變包括伴角化過度的慢性皮炎，角化不全，顆粒形成增多或減少，棘細胞層水腫，單核細胞侵入和中、重度棘皮症。其他改變包括多環紅斑樣損害時呈表皮下水皰，變應性血管炎致血管改變，伴有淋巴細胞、組織細胞、中性粒細胞和嗜酸性粒細胞。進一步可出現肉芽腫樣反應，表皮與真皮上層基本正常，而真菌中層在擴張的血管附近可見中性粒細胞、嗜酸性粒細胞、淋巴細胞、組織細胞和漿細胞。
膿皰可出現在角層下和毛囊。毛囊炎和毛周炎一般與毛囊存在真菌成分相關。炎症改變從外層毛根鞘的棘細胞層水腫到深部毛周肉芽腫性反應伴壞死和異物性巨細胞，可能由斷裂毛囊排出的毛發誘導。對於膿癬組織學表現為亞急性皮炎和明顯的毛囊炎，伴異物性巨細胞的彌散的肉芽腫樣炎症反應、血管改變和纖維化。典型的環癬，在損害邊緣有顯著的炎症改變，包括血管周圍淋巴細胞浸潤。
