腸重複畸形腸道存在著的一種問題，也是一種需要及時進行治療的一種健康問題，因為腸道對於人體的消化和吸收功能影響還是比較大的，如果腸道存在著畸形的話，對於人體健康造成的影響，也是非常大的。可以說，腸重複畸形手術是一種比較大的手術了。
1.重複畸形囊腫切除術
部分小腸重複畸形具有單獨的係膜和血管支，可將囊腫完整切除。對重複畸形緊密依附於主腸管係膜內者，術者應於主腸管與畸形囊腫之間仔細尋找直接營養囊腫的血管分支。Norris指出，當在主腸管與重複畸形之間存在著較清楚的空隙時，表明畸形腸管有其獨立的血管分支，該血管分支從腸係膜的前葉(或後葉)發出走向畸形囊腫的前壁(或後壁)。反之營養主腸管的血管支則由腸係膜後葉(或前葉)經畸形後壁走向主腸管。手術中如認真辨認仔細操作，可將畸形囊腫分離切除而不損傷主腸管的血液供應。
2.重複畸形與主腸管切除腸吻合術
與主腸管共享營養血管及肌壁的重複畸形和腸壁內重複畸形難以單獨切除。如病變範圍小(長度＜35cm)，可將畸形連同主腸管一並切除行腸端端吻合術。憩室狀重複畸形可將遊離的部分完整分離，再將其與主腸管連接部一並切除行腸吻合術。此類手術雖簡單易行，術者也應謹慎操作，掌握好分寸，既要滿意切除重複畸形，也不應任意犧牲正常的腸管。回腸末段的重複畸形切除時更需慎重，凡距離回盲瓣1Ocm以上的畸形應盡量保留回盲瓣。位於回盲瓣附近或緊鄰回盲瓣的囊腫，需切除回盲部。考慮到回盲瓣的重要生理功能，切除回盲部不利於小兒的生長發育和生活質量，有作者提出采用腸壁肌層切開，剝除囊腫壁保留回盲部的設想，這種想法能否實施，尚有待實踐證實。
3.重複畸形黏膜剝除術
範圍廣泛波及小腸大部的重複畸形，腸切除將導致短腸綜合征者僅行畸形腸管黏膜剝除術。沿重複腸管一側縱形切開肌壁達黏膜下層，銳性分離黏膜，於黏膜下注入適量生理鹽水更便於黏膜剝離，將黏膜完整摘出切除。然後切除部分重複畸形的肌壁，其切緣縫合或電凝止血。倘若重複畸形與主腸管有交通開口，則將重複畸形黏膜剝離後，連同與主腸管連接段一並切除。
