作為一種非常寶貴的重要，靈芝有野生的也有人工養殖的，兩種類型的靈芝區別比較大，比如野生靈芝因為沒有人工栽培，所以不會受到農藥等殘害，所以野生靈芝更加寶貴。
1.品種：世界上野生靈芝250多種，目前我國對其中104種已經有了較明確的認識，還有一些品種有待於開發，而養殖的靈芝目前隻有5種。野生靈芝即使是在同一種靈芝中、在任何數量下都找不到兩個完全相像的，而養殖靈芝從顏色、形狀上都非常相像。
2.生長期：野生靈芝，除我國的無柄赤芝為一年生外，大多為子實體多年生植物，有的野生靈芝生長期為數百年，其積累的藥用價值更為顯著，它神奇的藥效為野生靈芝披上了一層神秘的色彩，而養殖靈芝生長期僅有一個月。
3.藥效積累：野生靈芝生長期越久藥效積累越強。而養殖靈芝的藥效是一代不如一代，到了第四代，養殖靈芝的藥用價值微乎其微。
4.寄居物：野生靈芝大多寄居於活樹幹、樹皮、木樁或朽木上。
5.繁殖：野生靈芝是擔孢子有性遺傳，二個雄性一個雌性結合，方能再繁殖成另一個小的野生靈芝。而養殖靈芝是無性遺傳。再生長方式是通過菌絲分裂來完成的。
6.形狀：野生靈芝無柄的居多，由於品種的不同形狀也不盡相同。而養殖靈芝由於品種受限，目前隻有一種有柄的靈芝。所以野生靈芝與養殖靈芝比較好區別。
7.農藥殘留：野生靈芝生長於大自然之中，沒有農藥及任何有害物質殘留，而養殖靈芝一般生長於人工搭建的大棚之中，需要進行防腐、防蟲處理，其農藥殘留就可想而知。
8.有機鍺與有機硒：靈芝中最有價值的有機鍺和有機硒在養殖靈芝中根本不含。每一克野生靈芝中含有機鍺800至2000微克，含有機硒1000至4000微克。是生長二十年野山參中有機硒含量的4-6倍。
9.靈芝多糖、靈芝酸、總三萜及大量的微量元素：野生靈芝中靈芝多糖及靈芝酸的含量是養殖靈芝的三到六倍。而總三萜及大量的微量元素在養殖靈芝中的含量也遠不如野生靈芝。
