陰莖結核主要通過陰莖與結核分枝杆菌直接接觸感染，少數為血行感染，嚴重的尿道結核也可波及陰莖。
主要通過陰莖與結核杆菌直接接觸發生感染。Lewis（1946）統計的65％的原發陰莖結核皆因宗教割禮包皮環切時，用口吸吮陰莖止血所引起，這種方法已棄用。陰莖頭與有病變的子宮頸接觸，亦可引起陰莖結核。血行感染則可直接侵犯陰莖海綿體，引起結核性海綿體炎。另一種傳染方式為嚴重的尿道結核發展成尿道周圍炎，最後侵及陰莖海綿體及陰莖頭。直接接觸感染病變多發生在陰莖頭、陰莖係帶或外尿道口，最初為結核結節，以後成為潰瘍，潰瘍境界清楚，周邊硬，基底部有幹酪樣壞死或肉芽組織。潰瘍逐漸擴大可侵及陰莖頭全部，腹股溝淋巴結亦常有繼發結核性感染。海綿體結核多表現為結節性增生，纖維組織可使陰莖變形彎曲，有時可形成瘺管。
陰莖海綿體受累時，陰莖勃起彎曲和疼痛，有時可形成瘺管。結核杆菌可以經尿道上行性感染影響膀胱、輸尿管、腎髒，導致膀胱結核、輸尿管結核、腎結核，可以出現血尿、膿性尿以及尿頻等改變，同時可並發輸尿管堵塞（稱作腎自截）、膀胱攣縮，使膀胱容積減小，並發嚴重的尿頻。
臨床表現有繼發於泌尿生殖係結核的尿頻、血尿病史。病變開始於陰莖頭、係帶、冠狀溝等處。初期為綠豆大小的硬結，周圍腫脹變硬，無疼痛，逐漸形成潰瘍，形狀不規則，邊緣呈潛入性，潰瘍表麵有膿苔，不易剝除，無觸痛。血沉快。華康氏反應陰性。
預防泌尿生殖係結核的根本措施是預防肺結核，由於近年來分子生物學的進展，人類可能運用新的預防、診斷及治療方法來消滅結核病
1、消滅傳染源：建立結核病監測網絡，及時發現病人，積極徹底治療，可迅速控製傳染源有效的化療雖然需數月才能使痰菌陰轉，但2周內可使患者的傳染性降低到幾乎消失
2、保護易感人群：接種卡介苗是預防結核病最有效的辦法，新生兒出生時即接種，以後每5年補種，直至15歲接種卡介苗有劃痕法和皮內注射法兩種在青少年中，對結素試驗陽性者，可采用INH化學性預防，每日300mg，持續半年到1年
3、切斷傳播途徑：活動期病人帶口罩，不隨地吐痰，防止大笑和情緒激昂的講話：保持室內通風，空氣清潔，紫外線照射消毒等，都是切斷傳播途徑的有效手段
陰莖結核在確診時，除依靠其臨床表現外，還需借助輔助檢查。陰莖結核無特殊相關檢查。可以取潰瘍分泌物直接塗片或結核菌培養可找到結核杆菌，或者做局部活檢，病理檢查可確診。
陰莖結核患的飲食是什麼，好的飲食辦法可以有助於患者的醫治及康複，以下幾種飲食可以有用調理增補患者身體所缺的養分。
1、飲食中應加入抗感染的食品，如胡桃、瓜簍、豆豉、橄欖、杏仁、絲瓜、鯽魚。
2、為增強免疫功能，可選用甲魚、烏龜、蝦、沙蟲、青魚、沙魚等。
3、對症選用抗潰瘍的食品，如薺菜、螺絲、金珍菜、海鷂魚、油菜、芋艿、綠豆、赤豆、陳小麥粉、馬蘭頭、泥鰍、鰣魚。
治療陰莖結核常用的西醫療法，具體如下：
1、尋找體內其他結核灶，首先處理腎結核、前列腺結核、附睾結核。
2、抗結核藥物治療。
3、陰莖結核抗結核藥物治療無效時，可行病變局部切除術。