可因膀胱結核蔓延而引起，亦可由前列腺精囊結核形成空洞破壞前列腺尿道所致。在泌尿生殖係結核中，結核是很罕見疾病，發病率不足1％。
可引起尿道周圍炎、尿道周圍膿腫或繼發感染，破潰後形成尿道瘺。尿道結核，多繼發於嚴重的泌尿生殖係結核，治療比較困難，如泌尿生殖係結核早期積極治療後恢複，而尿道狹窄的範圍又較小，則預後較好。陰莖結核過去唯一有效的治療方法是陰莖切除，由於抗結核藥物的進展，隻要積極配合醫生的治療，單用抗結核藥物即可能治愈，並可保全陰莖的完整。
1、尿道結核：尿道分泌物，尿頻、尿痛、尿道流血或血尿，尿道狹窄時出現排尿困難，尿線變細，尿射程縮短，排尿無力，會陰部捫到粗，硬呈素條狀的尿道，可引起尿道周圍炎，尿道周圍膿腫或繼發感染，破潰後形成尿道瘺。
2、陰莖結核：陰莖頭上硬結、不痛、破潰後呈潛行性潰瘍，其底部有幹酪壞死組織及肉芽組織，潰瘍長期不愈。
1、及早診斷和治療：如患有結核病，應及早診治，以避免病情惡化和預防散播病菌；結核病患者可到任何一間胸肺科診所接受治療
2、為曾與結核病人有緊密接觸者檢查：這主要是替病者之家人檢查，包括對幼童的結核菌素試針及/或照肺，及對較大兒童和成人照肺檢查
3、健康生活：結核菌是在人體抵抗力下降時侵襲而致病的，故此應保持健康生活，以減低發病的機會，這包括：適量運動，充足睡眠，均衡飲食，避免煙酒，呼吸新鮮空氣，保持室內空氣流通，個人衛生（例如：避免麵向他人咳嗽或打噴嚏）
4、卡介苗防疫注射：衛生署胸肺科對香港所有初生嬰兒提供卡介苗防疫注射服務；對於在香港居住的十五以下的小童，如從未注射卡介苗，亦建議他們接受此疫苗的注射
一、尿道結核
1、尿道分泌物，尿頻，尿痛，尿道流血或血尿。
2、排尿困難，尿線變細，尿射程縮短，排尿無力。
3、會陰部捫到粗，硬呈索條狀的尿道或形成尿道婁。
4、尿道造影示尿道狹窄。
5、尿道分泌物直接塗片找到結核菌有助診斷。
6、經尿道行活組織檢查可確診。
二、陰莖結核
1、陰莖頭上硬結及慢性潰瘍。
2、直接塗片或結核菌培養找到結核桿菌可區別軟性下疳，硬性下疳，陰莖阿米巴病和陰莖癌。
3、病理活檢可確診。
一般情況下，尿道與陰莖結核患者的營養供應，包括熱源物質、蛋白質及維生素均要略高出普通人，以適應結核治療時的營養需求。
1、首先處理腎結核、前列腺結核、附睾結核；
2、抗結核藥物治療；
3、尿道狹窄者行尿道擴張；
4、不能進行尿道擴張或擴張效果不好的患者行膀胱造瘺；
5、陰莖結核抗結核藥物治療無效時，可行病變局部切除術；
6、尿道狹窄局限可將狹窄瘢痕切除對端吻合或尿道鏡窺視下行尿道內切開術；
7、尿道狹窄治療有困難者有時需作尿流改道術；
8、如出現腎功能衰竭，可按慢性腎功能衰竭常規治療，主要是透析療法或腎移植。