血吸蟲的尾蚴、童蟲、成蟲及蟲卵對人體均可引起一定的損害，但以蟲卵對人的危害最著，主要引起大腸和肝髒的病變。蟲卵沉著在人的腸壁組織中，其周圍出現細胞浸潤，形成蟲卵肉芽腫，這是發生慢性因血吸蟲肝、腸病變的根本原因。肉芽腫形成和發展的病理過程與蟲卵發育程度有密切的關係。當蟲卵尚未形成毛蚴時，其周圍的組織無反應，或僅有輕微的反應；卵內毛蚴形成發育時，組織遂開始出現炎症反應；卵內毛蚴成熟後，自毛蚴分泌的酶、蛋白質及糖等分泌物（蟲卵可溶性抗原）引起組織壞死和急性炎症反應，卵集存處常有血管內膜炎並形成嗜酸性膿腫；感染嚴重時亦可形成嗜中性粒細胞膿中。日本血吸蟲卵肉芽腫內常含有成族的蟲卵，故引起的損害較其他血吸蟲嚴重。
少數患者可有腹水形成，這是由於急性蟲卵結節所產生的炎症滲液以及蟲卵引起肝髒內廣泛病變，使肝內血流不暢，淋巴增多而漏入腹腔所致。其他可有肝、脾腫大等。晚期血吸蟲病，由於反複感染，病情逐漸加重，出現肝硬化。門靜脈壓增高引起腹水，脾髒顯著腫大。
在接觸疫水後數小時到2～3天內，尾蚴侵入處出現蚤咬樣紅色點狀皮疹，為尾蚴皮炎，有瘙癢，數天後自退。尾蚴行經肺部時可引起咳嗽、咳血。血吸蟲病的臨床表現十分複雜而多樣化，視蟲卵沉著部位、感染輕重和機體反應而異。按其病程和主要臨床表現可分為急性、慢性與晚期血吸蟲病。
一、急性血吸蟲病
急性血吸蟲病為季節性傳染病，多見於夏秋季節，以男性青壯年為多。大部發生在過去無免疫性而新近有大量尾蚴感染者，主要是常與疫水接觸之故。患者感染史較明顯，且多數有尾蚴皮炎史。患者全身主要症狀有發熱及過敏反應，皆由蟲卵毒素和組織破壞後的代謝產物所引起。因蟲卵在腸道大量沉積造成急性結腸炎，患者中出現腹痛、腹瀉的占半數以上。腹瀉每日2～3次，糞便稀薄，可帶血和粘液。
二、慢性血吸蟲病
由於感染程度不同，慢性血血吸蟲病有無症狀和症狀之分。
1、無症狀患者：輕度流行區以無症狀患者占大多數，其健康情況和勞動力可不受影響，僅於集體普查或因其他疾病就醫時偶然發現。城市中所見的血吸蟲病多數也屬此類，患者大多既無症狀亦無陽性體征，少數患者可有輕度肝或脾髒腫大。
2、有症狀患者：乙狀結腸與直腸為血吸蟲病病變的主要部位，故腹瀉與痢疾樣大便頗為常見。其輕重則因感染而異，通常以輕者為多。患者偶有腹瀉，每日2～3次，間或便中帶血。重者可有腹絞痛、裏急後重感、痢疾樣大便等。乙狀結腸因蟲卵沉著及纖維化而增厚，並有壓痛。糞便中容易找到血吸蟲卵。
另外，患者大多顯示不同程度的貧血、消瘦、營養不良和勞動力減退。患者肝脾切見腫大，在早期肝大於脾。肝髒表麵光滑，稍硬。感染較輕者可停於這一階段而不再進展，重症而病程長者可發展為肝硬化。肝髒漸見縮小，但仍可捫及，特別是左葉。肝髒質硬，表麵凹凸不平，有大小不等的結節。而後脾髒漸呈充血腫大。
三、晚期血吸蟲病
由於反複感染，患者病情逐漸加重，出現肝硬化。門靜脈壓增高引起腹水和脾髒顯著腫大。部分患者常發熱、腹痛、腹瀉和下痢、食欲不振、體重減輕等，並常貧血、營養不良性水腫。兒童若感染嚴重，能影響發育，可形成侏儒症。部分患者經常發熱，但一般不超過38℃，可能與蟲卵病的毒素對肝組織的破壞有關。此外，性機能往往減退，男性有性欲減退和陽瘺，女性則有閉經和不孕。患者麵容蒼老而消瘦，外觀較實際年齡大，常有麵部褐色素沉著。晚期時肝髒縮小，表麵不平，質堅硬，脾髒漸呈充血性腫大。
血吸蟲腸病具有傳染性，所以應積極預防預防方法主要是以下幾種：
1、消滅傳染源
加強糞便管理，避免新鮮糞便汙染水源建造無害化糞池，或糞尿混合加蓋貯存，使尿素分解為氨，可以殺死蟲卵糞便中加生石灰或碳酸氫胺也可殺死蟲卵
2、消滅中間宿主釘螺
滅螺應根據釘螺的生態特點和地理條件，因地製宜，改變釘鏍滋生環境，結合物理和化學藥物滅螺物理滅螺方法有鏟草、火燒、土埋等；化學滅螺藥物有氯硝柳胺、五氯酚鈉、煙酰苯胺等
3、個體防護
個人應盡量避免與疫水接觸如必須在疫水中作業時則須采取防護措施皮膚可塗抹防護藥物，如氯硝柳胺或鄰苯二甲酸二丁酯油膏、乳劑，或穿防水膠鞋、塑料防護褲等
血吸蟲腸病在診斷時，除了感染病史及臨床症狀外，還要依靠化學檢查結果。主要的檢查方法有以下幾種。
1、糞便檢查：從糞便中檢出蟲卵或孵出毛蚴可明確診斷。輕度感染者、晚期患者及治療未愈合者，糞中卵數很少，檢出率低，故糞檢陰性不能排除血吸蟲病。
2、腸粘膜活體組織檢查：按常規將乙狀結腸鏡或直腸鏡由肛門插入，先肉眼觀察腸粘膜的改變。急性期以充血水腫為主，慢性期則粘膜蒼白、肥厚，形成瘢痕。各期均可見典型的小結、小斑。然後夾取疑含蟲卵結節的粘膜病變組織，壓於兩載玻片之間鏡檢。對未經治療的患者，檢出的蟲卵不論死活，均有確診價值；對有治療史的患者的，則隻有查見活卵或近期變性卵才有診斷意義。
3、免疫學檢查：主要的免疫學檢查有環卵沉澱反應試驗、尾蚴膜反應、蟲卵抗原間接血凝試驗、血吸蟲循環抗原(CAg)等。
血吸蟲腸病患者的飲食以清淡、易消化為主，多吃蔬果，合理搭配膳食，注意營養充足。此外，患者還需注意忌辛辣、油膩、生冷的食物。
治療血吸蟲病的藥物有吡喹酮、呋喃丙胺、硝硫氰胺等藥物，但目前吡喹酮為首選藥物。
1、吡喹酮
吡喹酮為一種新的廣譜抗蠕蟲藥，對人體3種主要血吸蟲和絲蟲均有殺蟲效果。治療劑量成人為每次10mg/kd，1日3次，間隔4小時，療程2日。兒童總劑量為日70mg/kg，分3次服用，療程1日。吡喹酮副作用輕而短暫，於服藥後1小時左右出現，主要有頭昏、頭痛、乏力、輕度腹痛等，不需處理，於停藥後數小時內消失。吡喹酮治療日本血吸蟲病有顯著療效。
2、呋喃丙胺
該藥對血吸蟲童蟲和成蟲均有一定殺滅作用。目前采用緩解腸溶片劑型，每天劑量60mg/kg（成人每天不超過3g），療效10天，總劑量為600mg/kg。其該藥的副作用為胃腸道反應，主要是食欲減退、惡心、嘔吐、腹痛和腹瀉，偶有便血。肌痙攣為呋喃丙胺的特殊副作用。
3、硝硫氰胺
硝硫氰胺係廣譜驅蟲藥。目前主要采用微粉膠囊型，顆粒直徑3～6μm，總劑量6～7mg/kg，等分3份，每晚服用1次，療效3日。遠期糞檢陰轉率可達80％左右。急性血吸蟲病用總劑量10mg/kg，6日療程。一般於開始服藥後8～24日體溫恢複正常，症狀得到改善。本藥的副作用以神經係統症狀為多見，如頭昏、頭痛、眩暈、乏力、嗜睡或失眠、步態不穩、眼球震顫、多法和肌肉顫動等。對於肝功能代償不良的晚期血吸蟲病患者、急性肝炎恢複期未滿1年和慢性肝炎、精神病史、孕婦、哺乳期婦女以及有心、腎等慢性疾病而體質虛弱者禁用。