真菌如同其他微生物，在變態反應的發生中有其一定規律性，但因其菌體大，細胞壁富有多糖體，有較複雜的代謝過程和酶係統以及潛在的抗原性等，故又與細菌和病毒不同。真菌過敏症與下列因素有關：
1、菌種類別，變應原較強的如曲黴、鏈格孢等，易致過敏。
2、孢子的抗原性較菌絲強。
3、個體的敏感體質也起重要作用。
真菌的孢子和菌絲經各種途徑進入人體後，都有可能引起過敏反應。真菌過敏症可能會導致繼發性細菌或真菌性角膜感染等並發症。
真菌過敏症在臨床上皮膚和呼吸道為主要反應器官。皮膚表現有過敏性皮炎、濕疹、遺傳過敏性皮炎、蕁麻疹、癢疹、瘙癢症、癬菌疹（可呈汗皰疹樣、濕疹樣、丹毒樣、多形紅斑樣、脂溢性皮炎樣、銀屑病樣、玫瑰糠疹樣、以至紅皮病樣等表現，而以汗皰疹最為常見）等。呼吸道表現有哮喘、過敏性鼻炎、農民肺等。此外尚有胃腸道、神經係統（如周期性偏頭痛）的過敏反應等。
有過敏體質的朋友在體質調理前後，蝦、蟹、貝類及冰冷飲料須盡量避免，以免症狀複發，影響治療的效果，並且須注意避免過敏原的刺激，平時多加運動，放鬆身心以增強免疫力，過敏體質必定會有顯著的改善通過先進的檢測技術準確找到過敏原，明確過敏原後，在日常生活中主動避免接觸
真菌過敏症最有效措施是尋找出過敏誘發因子，避免再接觸這種物質，但要在2萬種不同的誘發因子中準確地找到致病的因子，不是件容易的事情。為檢測一種物質的致敏反應，醫生需要做各種不同的皮膚測試，費時費事，更因為許多致敏物質是不可以完全避的，比如藥物和昆蟲等防不勝防。
有過敏體質的患者在體質調理前後，蝦、蟹、貝類及冰冷飲料、食品須盡量避免，以免症狀複發，影響治療的效果。真菌過敏症患者應注意飲食清淡富於營養，多吃新鮮的蔬菜和水果。新鮮的蔬菜和水果含有大量人體所需的營養成分。患者還應多吃提高免疫力的食物，以提高機體抗病能力。
真菌過敏症的治療首先要去除致敏真菌（如治療有關真菌病，停用致敏抗生素等），使用抗組胺類藥物及對症治療，重者可用腎上腺皮質激素。