肝硬化往往因並發症而死亡。
一、上消化道出血
為本病最常見的並發症，多突然發生，出血量大、除嘔鮮血外，常伴有血便。易出現休克及誘發肝性腦病，病死率較高。許多患者過去有消化道出血史。在肝硬化患者上消化道出血中，除因食管胃底靜脈曲張破裂外，部分患者出血的原因為並發急性胃粘膜病變或消化性潰瘍。鑒別需作內鏡檢查。
二、肝性腦病
見於嚴重肝病患者，是以代謝紊亂為基礎的中樞神經係統的綜合症，臨床上以意識障礙和昏迷為主要表現。是肝硬化最常見的死亡原因，亦可見於重症肝炎、肝癌、嚴重的阻塞性黃疸及門腔靜脈分流術後的病人。
三、感染
肝硬化患者抵抗力低下，肝髒枯否氏細胞功能減退，加之腸道瘀血，細菌易透過腸壁進入腹腔，或進入門脈、經側支直接進入體循環，故常並發感染如肺炎、膽道感染、革蘭氏陰性杆菌敗血症和原發性腹膜炎等。自發性腹膜炎的致病菌多為大腸杆菌及副大腸杆菌，近來發現厭氧菌也是致病菌之一。一般起病較急，主要表現為腹痛和腹脹。有發熱、惡心、嘔吐與腹瀉，嚴重者有休克。患者腹水迅速增長，腹部有不程度的壓痛和腹膜刺激征。腹水多為滲出液，但因滲出的腹水常被原有的漏出性腹水所稀釋，其性質可介於漏出和滲出液之間，腹水應作普通細菌和厭氧菌培養及藥物敏感試驗。本並發症病情嚴重，需及時發現，積極治療。
四、功能性腎衰（肝腎綜合征）
肝硬化有大量腹水時，由於有效循環血容量不足等因素，可出現功能性腎衰，又稱肝腎綜合症。其特點為自發性少尿或無尿、稀釋性低鈉血症、低尿鈉和氮質血症。患者腎髒缺乏器質性改變，將其移植給他人可發揮正常的腎功能，說明腎衰是功能性的，而非器質性損害。上消化道出血、休克、大量的腹水和強烈利尿、內毒素血症和鈉水代謝紊亂等與本病密切相關。
五、電解質和酸堿平衡紊亂
肝硬化患者在腹水出現以前已有電解質紊亂，出現腹水和其他並發症後，電解質紊亂更加嚴重。常見者為低鈉血症、低鉀低氯血症與代謝性堿中毒，並誘發肝性腦病。故應及時糾正。
六、原發性肝癌
相當多的原發性肝癌是在肝硬化基礎上發生的。當肝硬化患者在短期內出現肝髒進行性增大、持續性肝區疼痛、肝髒發現腫塊、腹水轉變為血性等，特別是甲胎蛋白增高，應警惕原發性肝癌的可能。
