過敏性休克應注意與以下疾病相鑒別:
(一)迷走血管性昏厥(或稱迷走血管性虛脫，vasovagal collapse) 多發生在注射後，尤其是病人有發熱、失水或低血糖傾向時。患者常呈麵色蒼白、惡心、出冷汗，繼而可昏厥，很易被誤診為過敏性休克。但此症無瘙癢或皮疹，昏厥經平臥後立即好轉，血壓雖低但脈搏緩慢，這些與過敏性休克不同。迷走血管性昏厥可用阿托品類藥物治療。
(二)遺傳性血管性水腫症(hereditary angioedema) 這是一種由常染色體遺傳的缺乏補體C1酯酶抑製物的疾病。患者可在一些非特異性因素(例如感染、創傷等)刺激下突然發病，表現為皮膚和呼吸道粘膜的血管性水腫。由於氣道的阻塞，患者也常有喘鳴、氣急和極度呼吸困難等，與過敏性休克頗為相似。但本症起病較慢，不少病人有家族史或自幼發作史，發病時通常無血壓下降、也無蕁麻疹等，據此可與過敏性休克相鑒別。
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