對HSV感染尚無特殊預防方法。因HSV，尤其是HSV-2與宮頸癌關係密切一般不主張用常規疫苗預防，但如分離純化病毒包膜上糖蛋白抗原作為疫苗，則可避免病毒核酸的潛在致癌危險。
接受骨髓移植的病人如移植前血清HSV抗體陽性移植後頭5周，80%的病人有病毒重新激活的機會。HSV抗體陽性的急性白血病病人在誘導化療期間25%產生HSV感染。亦有作者發現：48%的急性白血病病人開始誘導化療後平均17天產生HSV重新激活。另一研究提示：HSV抗體陽性的病人66%病人病毒重新激活，HSV抗體陰性的病人則無感染。免疫受損的癌症患者HSV反複感染，尤其是血液腫瘤，可能比無免疫受損的病人更為多見、嚴重和持續時間長。如未進行抗病毒治療，病毒可持續播散，病灶加重，合並細菌和真菌感染的危險性增加。
阿昔洛韋的預防HSV感染作用在急性白血病化療或準備接受骨髓移植的患者，效果明顯，靜脈用藥尤佳。在血清抗體陽性的其他癌症患者應暫時不進行預防性用藥，除非確定在化療時合並HSV感染。一旦用藥應在整個化療期間持續用藥，或用至免疫抑製狀態恢複。急性白血病誘導化療的患者，在白細胞缺乏症和化療的鞏固維持階段應繼續用藥。骨髓移植患者移植後阿昔洛韋至少用藥4～6周。預防性靜脈應用阿昔洛韋每12小時250mg/m2，在90%的病人可產生病毒抑製。根據阿昔洛韋的藥代動力學，每12小時75～125mg/m2靜脈應用亦可能有效。預防性口服阿昔洛韋亦有效，800mg口服，每天2次，可有明顯的預防作用。然而，在癌症病人，靜脈和口服用藥可聯合應用，尤其當病人有惡心、嘔吐、吞咽困難時。阿昔洛韋預防性口服應限製於可能感染的人群。
