單純皰疹病毒性肺炎的臨床表現與其他下呼吸道感染近似：咳嗽、氣急、發熱(>38.5℃)、白細胞降低、肺部囉音、低氧血症、呼吸功能不全、氮質血症。常見的初發症狀為氣急和咳嗽。HSV肺炎可伴有皮膚黏膜HSV損害，且早於肺炎出現。可同時伴有彌漫性真菌、巨細胞病毒或細菌感染。單純皰疹病毒性氣管支氣管炎可表現為常規治療無效的支氣管痙攣或狹窄，病人可無慢性肺部疾病和無免疫抑製性疾病，有時可引起急性呼吸衰竭需機械通氣治療。
HSV肺炎的臨床表現和放射學表現為非特異性。單純皰疹病毒性肺炎的診斷，除肺炎臨床表現外，須依靠HSV肺部感染的組織學依據和肺部病毒的分離。直接從下呼吸道分離出病毒，最好從肺組織，具有明確的診斷意義。氣管鏡檢查結合細胞學檢查和病毒培養有診斷意義，雖然並非必須，但可提供組織標本。纖維支氣管鏡檢查顯示氣管支氣管黏膜潰瘍和(或)覆蓋有假膜，該檢查可引導抽吸、支氣管衝洗或活檢。細胞學和組織學檢查可提供HSV感染的特異性證據：多核巨細胞和核內嗜酸性包涵體。另外活檢標本檢查示炎性浸潤，實質壞死和出血。
在免疫抑製的患者，如有廣泛的皮膚黏膜單純皰疹病毒感染並且伴有局限性或廣泛性的肺部浸潤，尤其存在食道炎或氣管炎或發現單純皰疹病毒播散至其他器官時應考慮皰疹病毒性肺炎。進一步講，口腔黏膜單純皰疹病毒感染的病人進行氣管插管時應考慮繼發單純皰疹病毒性肺炎的可能。應當進行病毒的肺活檢組織病毒培養、組織學檢查、通過免疫熒光進行單純皰疹病毒抗原的組織檢查。
在常規治療無效的急性支氣管痙攣病人應考慮單純皰疹病毒下呼吸道感染的可能。
