陰莖長小肉疙瘩可能是因為珍珠疹、毛囊炎、尖銳濕疣等，要及時地采取針對性的處理。
1、珍珠疹：陰莖部位如果長時間的摩擦引起的珍珠疹，可能會導致局部有小肉疙瘩，一般不需要采取特殊的治療。
2、毛囊炎：陰莖部位如果受到了病原菌感染，引起了毛囊炎症，可能會伴有小疙瘩的症狀，配合醫生使用紅黴素軟膏、糠酸莫米鬆乳膏、高錳酸鉀溶液等藥物治療。
3、尖銳濕疣：陰莖上的小肉疙瘩也有可能是因為人乳頭瘤、病毒感染引起了贅生物，可以配合醫生做液氮冷凍手術治療。
除了以上原因以外，也有可能是因為過敏性炎症等，要及時地就診治療。
