人體腸道中的細菌種類非常的多，達到四、五百種，其中有一部份的細菌會分泌類似抗生素的物質，人類使用益生菌可以從食物中攝取，也可以從益生菌的保健食品做成的膠囊或粉末來攝取。這邊整理出一般人服用益生菌的三大問題:
一、吃益生菌的好處:
1.在腸道中合成營養素：益生菌可以在我們的腸道內製造維生素Ｂ群、維生素K、短鏈脂肪酸、胺基酸等等。
2.抑製壞菌生長：有些益生菌可以產生乳酸易致壞菌的生長，使壞菌不易附著於腸黏膜或穿透腸黏膜而進入血液中，並且保護腸壁健康。
3.提升免疫力:部分益生菌可以增強免疫細胞淋巴球等功能，並刺激抗體的產生，借以增強人體對病毒及細菌的抵抗力。
二、該怎麼選購益生菌:
1.菌株是否有醫學文獻佐證，可以選擇不同品牌的優酪乳其製品、補充品，可獲得不同菌種屬的益生菌，因每種菌屬都有其特殊的功能，有些是調節免疫力，有些是針對腸道功能的。
2.美國優酪乳營養管製協會規定：每一克優酪乳培養菌需含有一億以上的CFU。食用益生菌的劑量以菌種形成單位(CFU)做計算，一般而言優酪乳150～200 克，約含100至2000億CFU。
3.益生菌必需要在有效期限中食用完畢，才能確保攝取到活菌的功能，如果具有國家健康認證的產品會更有保障。
三、如何吃益生菌最好?
1.搭配益生素(益生菌的食物):要讓益生菌長的好，就必須給它充足的食物，新鮮的蔬菜水果富含高纖，就是益生菌最好的食物。
2.如服用抗生素時，要注意服用後2小時再補充，因為這樣益生菌較容易存活
3.現在技術較良好，但購買後，建議還是放在冰箱，進行冷藏或冷凍，有利保留更多的活菌。
4.益生菌以早上或睡前空腹時服用效果最好。
