此病的病因尚未完全闡明，一般認為和病毒感染因素有關。
1、病毒因素。發病前患者常有上呼吸道感染史，發病常隨季節變動、且具有一定的流行性。
2、病毒感染引起的變態反應。患者血中有病毒抗體存在（抗體的效價高度和病期相一致），最常見的是柯薩奇病毒抗體，其次是腺病毒抗體、流感病毒抗體、腮腺炎病毒抗體等。雖然已有報告，從亞急性甲狀腺炎患者的甲狀腺組織中分離出腮腺炎病毒，但亞急性甲狀腺炎的原因是病毒的確實證據尚未找到。
3、遺傳因素。中國人，日本人的亞急性甲狀腺炎與HLA-Bw35有關連，提示對病毒的易感染性具有遺傳因素，但也有患者與上述HLA-Bw35無關。
甲亢時引起的眼部改變，一類是良性突眼，患者眼球突出，眼睛凝視或呈現驚恐眼神;另一種是惡性突眼，可以由良性突眼轉變而成，惡性突眼患者常有怕光、流淚、複視、視力減退、眼部腫痛、刺痛、有異物感等，由於眼球高度突出，使眼睛不能閉合，結膜、角膜外露而引起充血、水腫、角膜潰爛等，甚至失明。
亞急性甲狀腺炎常在病毒感染後1-3周發病，有研究發現該病有季節發病趨勢(夏秋季節，與腸道病毒發病高峰一致)，不同地理區域有發病聚集傾向。起病形式及病情程度不一。
一、上呼吸道感染前驅症狀。肌肉疼痛、疲勞、倦怠、咽痛等，體溫不同程度升高，起病3-4d達高峰。可伴有頸部淋巴結腫大。
二、甲狀腺區特征性疼痛。逐漸或突然發生，程度不等。轉頸、吞咽動作可加重，常放射至同側耳、咽喉、下頜角、頦、枕、胸背部等處。少數患者聲音嘶啞、吞咽困難。
三、甲狀腺腫大。彌漫或不對稱輕、中度增大，多數伴結節，質地較硬，觸痛明顯，無震顫及雜音。甲狀腺腫痛常先累及一葉後擴展到另一葉。
四、與甲狀腺功能變化相關的臨床表現：
1、甲狀腺毒症階段：發病初期約50％-75％的患者體重減輕、怕熱、心動過速等，曆時約3-8周；
2、甲減階段：約25％的患者在甲狀腺激素合成功能尚未恢複之前進入功能減退階段，出現水腫、怕冷、便秘等症狀；
3、甲狀腺功能恢複階段：多數病人短時間(數周至數月)恢複正常功能，僅少數成為永久性甲狀腺功能減退症。整個病程約6—12個月。有些病例反複加重，持續數月至2年不等。約2％-4％複發，極少數反複發作。
預防亞急性甲狀腺炎主要是需要有健康的生活態度，營養均衡，規律運動，增強機體抵抗力，避免上呼吸道感染及咽炎
1、規律運動亞急性甲狀腺炎病因多考慮與病毒感染相關，故需規律運動，增強體質，預防感染
2、生活節製注意休息、勞逸結合，生活有序，保持樂觀、積極、向上的生活態度對預防疾病有很大的幫助做到茶飯有規律，生存起居有常、不過度勞累、心境開朗，養成良好的生活習慣對預防亞急性甲狀腺炎有益
3、合理膳食可多攝入一些高纖維素以及新鮮的蔬菜和水果，營養均衡，包括蛋白質、糖、脂肪、維生素、微量元素和膳食纖維等必需的營養素，葷素搭配，食物品種多元化，充分發揮食物間營養物質的互補作用，對預防此病也很有幫助
患者如有發熱，短期內甲狀腺腫大伴單個或多個結節，觸之堅硬而顯著壓痛，臨床上可初步擬診為本病。實驗室檢查早期血沉增高，白血球正常或稍高。血T3，T4增高，而血TSH降低，測攝碘率可降至5％～10％以下。這一特征對診斷本病有重要意義。血甲狀腺免疫球蛋白初期也升高，其恢複正常也比甲狀腺激素為晚。超聲波檢查在診斷和判斷其活動期時是一個較好的檢查方法。超聲波顯像壓痛部位常呈低密度病灶。細胞穿刺或組織活檢可證明巨核細胞的存在。
1、紅細胞沉降率(ESR)：病程早期增快，>50mm/lh時對本病是有利的支持，ESR不增快也不能排除本病。
2、甲狀腺毒症期呈現血清T4、T3濃度升高，甲狀腺I攝取率降低(常低於2％)的雙向分離現象。血清T3/T4比值常
3、甲狀腺細針穿刺和細胞學(FNAC)檢查：早期典型細胞學塗片可見多核巨細胞、片狀上皮樣細胞、不同程度炎性細胞；晚期往往見不到典型表現。FNAC操作方便，損傷小，特異性僅次於病理檢查，有經驗的醫生診斷準確率可達95％。對於不能明確診斷的甲狀腺疾病，可行細針穿刺活檢，但亞急性甲狀腺炎不常規推薦FNAC檢查。
4、甲狀腺核素掃描(Tc或I)：早期甲狀腺無攝取或攝取低下對診斷有幫助。
5、其他：早期白細胞可增高。甲狀腺過氧化物酶抗體(TPOAb)、甲狀腺球蛋白抗體(TgAb)陰性或水平很低。這些均不作為本病的診斷指標。血清甲狀腺球蛋白(Tg)水平明顯增高，與甲狀腺破壞程度相一致，且恢複很慢。
亞急性甲狀腺炎多見於中年婦女。發病有季節性，如夏季是其發病的高峰。起病時患者常有上呼吸道感染。典型者整個病期可分為早期伴甲狀腺機能亢進症，中期伴甲狀腺機能減退症以及恢複期三期。
亞急性甲狀腺炎患者在日常生活中要多注意飲食的科學。
1、少食多餐，不能暴飲暴食。忌辛辣、興奮、提神的食物，如蔥、蒜、薑、花椒、咖啡、可可等。
2、補充充足的水分。每天飲水2500ml左右，忌咖啡、濃茶等興奮性飲料。
3、適當控製高纖維素食物，尤其腹瀉時。
4、注意營養成分的合理搭配。
5、禁食海帶、海魚、海蟄皮等含碘高的食物。由於碘在空氣中或受熱後極易揮發，故隻需將碘鹽放在空氣中或稍加熱即可使用。
6、進食含鉀、鈣豐富的食物。
7、病情減輕後適當控製飲食。
亞急性甲狀腺炎有多種治療措施，包括硫脲類藥、促甲狀腺激素及抑製劑量的甲狀腺激素。采用這些藥物影響疾病過程的證據尚不能令人認同。
對本病無特殊治療。腎上腺糖類皮質激素對本病有顯著效果，用藥1～2天內發熱和甲狀腺疼痛往往迅速緩解，一周後甲狀腺常顯著縮小。開始時可給強的鬆，每日3、4次，每次10mg，連用1～2周，以後逐步每周遞減5mg/d，全程1～2月，停藥後，如有複發，可以強的鬆再治，並可加用甲狀腺片劑，尤其有甲減者，每天可用40～120mg，幾個月後，漸而停用。鎮痛退熱如消炎痛等藥物，對本病也有效。治療包括兩方麵：減輕局部症狀和針對甲狀腺功能異常影響。一般來說，大多數病人僅對症處理即可。對輕型病例，采用阿司匹林或其他止痛藥，如用對乙酰胺基酚0.5g，3～4次/d，或用水楊酸鹽0.65g，每4小時1次，可控製症狀；如48h無效，在病情嚴重病例，如疼痛、發熱明顯者，可短期用其他非類固醇抗炎藥或應用糖皮質類固醇激素，如潑尼鬆，通常為每次10mg，3次/d，最多可用至40mg/d，可迅速緩解臨床表現，約有5％的患者需用皮質激素來減輕症狀，持續用藥1～2周，甚或4～8周，以後減少藥量，共用6～8周。如病人在用潑尼鬆24～48h無反應，亞急性甲狀腺炎的診斷應再評定。在治療中隨查血沉改變，可指導用藥。如病情需要，再次開始用潑尼鬆仍然有效。然而，皮質激素並不會影響本病的自然過程，如果皮質激素用後撤減藥量過多、過快，反而會使病情加重。也有人提出，如果糖皮質激素連續使用，所用劑量以使病人不出現症狀，直至其放射性碘攝取率恢複正常，可能避免病情複發。病人伴有甲狀腺功能亢進時，一般不采用抗甲狀腺藥治療，通常采用非特異的藥物如口服阻滯劑普萘洛爾，每天最多30mg，常可奏效。因本病伴甲亢是暫時的，且甲狀腺攝碘率低，不是放射碘治療的指征。這些藥破壞甲狀腺激素的合成，但亞急性甲狀腺炎血中過多的甲狀腺激素是來源於被破壞了的濾泡漏出的T4和T3，而不是由於合成和分泌增多所致，無需使用硫脲類抗甲狀腺藥。本病的甲減期也常是暫時的，通常甲減症狀不多，所以不需甲狀腺激素替代治療。此時TSH分泌增加對甲狀腺功能的恢複是重要的。除非病人甲減症狀明顯，甲狀腺激素治療應當禁忌。伴甲減病情輕者無需處理。但也有人主張有甲狀腺功能低減時，可用甲狀腺製劑，如L-型甲狀腺素鈉0.1～0.15mg/d，可防止由TSH升高引起的病情再度加重。病情較重者，可用甲狀腺激素替代一段時間。約有10％的患者可發生永久性甲狀腺功能低減，需要長期甲狀腺替代治療。有稱中藥對本病急性期有較好的治療效果。
手術治療是不適宜的，除非伴有甲狀腺腫瘤者，或極少數疼痛長期不能緩解者，才需切除病變的甲狀腺。