惡性肉芽腫的病因未明，有腫瘤、變態反應或自身免疫和病毒感染等學說。
類腫瘤學說
多數學者認為本病是淋巴係統的惡性腫瘤，類似網狀細胞肉瘤或淋巴瘤，有腫瘤性增生的異形細胞及分裂相，無壞死性血管及多核巨細胞。本病限於鼻部和呼吸道，至病晚期，身體各處如內髒、淋巴結及骨髓均可顯示同樣病變，故極似惡性腫瘤之轉移。部分病人放射治療可獲痊愈，符合腫瘤學說。
變態反應或自身免疫
近年研究認為本病為一種過敏現象，尤為血管對細菌毒素之過敏反應，極似Arthus壞死現象。在毛細血管壁內有免疫球蛋白沉積，並在疾病活動期病人血清中出現免疫複合物，應用免疫抑製劑治療，症狀緩解時則消失。免疫熒光試驗，發現腎小球甚底膜有C3和lgG，電鏡檢查看到基底膜內有免疫複合體一樣的粗顆粒狀物，環免疫複合物升高。故有人認為鼻部惡性芽腫、結節性動脈周圍炎及Wegener肉芽腫同屬一類疾病，唯症狀不同而已，皆為自身免疫性疾病。
病毒感染學說
新近研究發現，在采取惡性肉芽腫組織進行細胞培養及病人血清內，均找到柯薩奇病毒小體，故認為本病與此病毒感染有關。
惡性肉芽腫早期主要為炎症，患者晚期可並發全身衰竭、膿毒血症、尿毒症、腦膜炎等。因此 ，對於該病，一定要早期發現、早期治療，避免病情加重，危機生命。
惡性肉芽腫症狀根絕其病情發展分為三期：前驅期、活動期和終末期。
前驅期
為一般傷風或鼻竇炎表現，間歇性鼻阻塞，伴水樣或帶血性分泌物，亦可表現為鼻內幹燥結痂。局部檢查為一般炎症表現，鼻中隔可出現肉芽腫性潰瘍。此期持續4—6周。
活動期
鼻通氣不暢或完全阻塞，有膿涕，常有臭味。全身情況尚可，出虛汗，食欲較差，常有低熱，少數有高熱，用一般抗生素治療無效。局部檢查見鼻粘膜腫脹，糜爛以至潰瘍，呈肉芽狀，表麵有灰白色壞死。多先累及下鼻甲或鼻中隔，明顯者可致鼻外部膨脹隆起，病變發展可造成鼻中隔穿孔或齶部穿孔。此期持續數周至數月。
終末期
病人衰弱，惡病質，局部毀容。鼻腔粘膜、軟骨、骨質及周圍組織如麵部、眼眶、額部甚至顱底可嚴重廣泛破壞，眼瞼及結膜腫脹，眼球突出，視力減退。最後因衰竭、出血或並發腦膜炎而死亡。
惡性肉芽腫的預防措施如下：
1、預防受到柯薩奇病毒的感染據新近研究發現，患有惡性肉芽腫的體內存在著柯薩奇病毒小體
2、避免出現過敏的症狀該疾病患者的血管對細菌毒素會有過敏反應，因此推斷與之有關，所以康複後的患者應該避免出現過敏現象
3、積極治療淋巴係統的惡性腫瘤淋巴係統的惡性腫瘤進行放射治療有助於腫瘤的消除要避免引起腫瘤的轉移進而導致惡性肉芽腫的出現
惡性肉芽腫的檢查方法主要有病理切片檢查和實驗室檢查：
1、病理切片檢查 呈現慢性非特異性肉芽腫性病變，若出現異型網織細胞或核分裂相即可診斷本病。
2、實驗室檢查 白細胞計數偏低，紅細胞沉降率加快；免疫球蛋白水平偏高；細菌、真菌和病毒培養多無特殊發現。
惡性肉芽腫的飲食注意事項主要有：
適宜飲食
飲食均衡，多食蔬菜、水果，並多飲水，促進毒素排泄。放療、化療期間的飲食，應該容易消化且富含蛋白質、維生素、氨基酸的營養物質，如海帶、紫菜、龍須菜、海蜇等。經常口含話梅、橄欖、青梅、無花果等，可刺激唾液分泌，減輕幹燥症狀。
禁忌飲食
飲食上要注意禁忌煙酒、辣椒等刺激性食品。少食或者不食醃製或黴變食物，如鹹魚、鹹菜、醃肉等。慎用蔥、芥菜，少用熱性補藥及補品，以防熱極化火。化療後應該注意保持口腔清潔。
惡性肉芽腫的治療以放療為主，配合抗癌藥物。惡性肉芽腫對放射線敏感，可采用60鈷遠距離照射療法和分次照射法，總劑量以60Gy（6000rad）為最好，複發者可補照。
對發熱而抗炎治療無效者，可先采用環已亞硝脲（CCNU）治療，其作用類似烷化劑，在體內可抑製核酸及蛋白質的合成，奏效快，短期治愈率高，尤以退熱效果為佳，退熱後再予放療，療效較好。發熱時也可先用類固醇激素類藥物控製體溫後，即刻放療。