本病的病因機製尚不清楚。文獻報道與睡眠障礙、神經遞質分泌異常及免疫紊亂有關。睡眠障礙、神經遞質分泌異常及免疫紊亂詳細介紹如下：
1、睡眠障礙
睡眠障礙累及60—90％的病人。表現為睡眠易醒、多夢、晨起精神不振、疲乏、有全身疼痛和晨僵感。夜間腦電圖記錄發現有α波介入到Ⅳ期δ睡眠波中。用鈴聲幹擾誌願者非快動眼睡眠(nonrapideyemovement)亦可誘導出上述腦電圖圖形及臨床症狀。其他影響睡眠的因素如精神緊張、環境噪音均可加重纖維肌痛綜合症症狀。因此推測，這種Ⅳ期睡眠異常在纖維肌痛綜合征的發開門見山中起重要作用。
2、神經遞質分泌異常
文獻報道血清素(serotonin，5-HT)和P物質(substanceP)等神經遞質在本病的發病中起重要作用。
血清素的前體是色氨酸、食物蛋白中的色氨酸在腸道被吸收後，大部分與血漿蛋白結合，小部分呈遊離狀態。遊離的色氨酸可被載體攜帶通過血-腦屏障進入腦組織。然後，在5-HT能神經元中經羥化和脫羧作用生成5-HT。釋放到突觸間隙的5-HT，在部分被突觸前神經末梢重攝取，部分經線粒體單胺氧化酶作用生成無活性的5-羥吲哚乙酸(5-hydroxyindoleaceticacid)。5-HT也存在於消化道粘膜、血小板及乳腺細胞中，由於它很難通過血-腦屏障，所以中樞神經係統與外周血中的5-HT分屬兩個係統。
另一種與纖維肌痛綜合征有關的神經遞質是P物質。Littlejohn發現，物理或化學刺激可誘導纖維肌痛綜合征病人產生明顯的皮膚充血反應，這種過度反應可能與存在著持續的末梢傷害刺激有關。由於這些刺激，皮膚多型傷害感受器(polymodalcutaneousnociceptor)反射性地從神經末梢釋放病理量的P物質，後者又可引起局部血管擴張，血管通透性增強及一種神經源性炎症(neurogenicinflammmation)。神經末梢釋放P物質後，背根神經節的初級感覺神經無將合成更多的P物質，以便維持一個恒定水平。合成的P物質同時向末梢和中樞？虼？藎？虼酥惺嗌窬？低車男物質含量增高。由於它的緩慢但持久而強烈的興奮作用，中樞神經係統必會受到一定影響。
此外還發現在正常或高水平的5-HT存在下，P物質對感覺神經衝動的發放有一個阻尼作用。缺乏5-HT，它將失去這種控製作用，導致痛覺過敏。
3、免疫紊亂
一些作者報道在纖維肌痛綜合征病人的真皮-表皮交界處有免疫反應物沉積，用電子顯微鏡觀察發現纖維肌痛綜合病人肌肉毛細血管內皮細胞腫脹，提示有急性血管損傷；組織缺氧及通透性增強。病人常述的原因不明的體重增加，手彌漫性腫脹及夜尿增多可能與通透性增強有關。
此外，初步研究發現，白介素-2(interleukin-2，IL-2)水平在纖維肌痛綜合征中升高。接受IL-2治療的腫瘤病人會出生纖維肌痛綜合征樣症狀，包括廣泛的疼痛、睡眠障礙、晨僵及出現壓痛點等。還發現α幹擾素可引起疲乏。上述現象提示免疫調節紊亂。體內細胞因子水平異常可能與纖維肌痛綜合征的發開門見山有關。
纖維肌痛綜合症最常見的發病年齡25—45歲，其臨床表現多種多樣的。該病是一種非關節性風濕病，其病理生理至今不明，可並發腸激惹綜合征、頭痛、抑鬱和焦慮症等。
纖維肌痛綜合征多見於女性，最常見的發病年齡25—45歲，其臨床表現多種多樣，但主要有下述4組症狀：
1、主要症狀：全身廣泛疼痛是所有纖維肌痛綜合征病人都具有症狀。雖然有的病人僅主訴一處或幾處疼痛，但1/4的病人疼痛部位可達24處以上，疾病遍布全身各處，尤以中軸骨骼(頸，胸椎，下背部)及肩胛帶，骨盆帶等處為常見，其他常見部位依次為膝、頭、肘、踝、足、上背、中背、腕、臀部、大腿和小腿，大部分病人將這種疼痛描寫為刺痛，痛得令人心煩意亂。
另一個所有病人都具有症狀為廣泛存在的壓痛點，這些壓痛點存在於肌腱，肌肉及其他組織中，往往呈對稱性分布，在壓痛點部位，病人與正常人對“按壓”的反應不同，但在其他部位則無區別。
2、特征性疾病：這一組症狀包括睡眠障礙、疲勞及晨僵。約90％的病人有睡眠障礙，表現為失眠、易醒、多夢、精神不振，夜間腦電圖顯示有α波介入到非快支眼節律中，提示缺乏熟睡。50—90％的病人有疲勞感，約一半病人疲勞症狀較嚴重，以至於感到“太累，無法工作”。晨僵見於76—91％的病人，其嚴重程度與睡眠及疾病活動性有關。
3、常見症狀：這一組症狀中最常見的是麻木和腫脹，病人常訴關節、關節周圍腫脹，但無客觀體征，其次為頭痛、腸激惹綜合征。頭痛可分偏頭痛或非偏頭痛性頭痛，後者是一種在枕區或整個頭部的壓迫性鈍痛。心理異常包括抑鬱和焦慮也比較常見，此外病人勞動能力下降，約1/3的病人需改換工作，少部分人不能堅持日常工作。以上症狀常因天氣潮冷、精神緊張、過度勞累而加重，局部受熱、精神放鬆、良好睡眠、適度活動可使症狀減輕。
4、混合症狀：原發性纖維肌痛綜合征很少見，大部分纖維肌痛綜合征病人都同時患有某種風濕病，這時臨床症狀即為兩者症狀的交織與重疊。纖維肌痛綜合征常使與之共存在風濕病症狀顯得更嚴重，如不認識這種情況常會導致對後者的過度治療和檢查。
纖維肌痛綜合征是一種特發性疾病，可繼發於外傷，各種風濕病，可通過以下幾種方法來進行預防：
1、居住的房屋應通風、向陽，保持室內空氣新鮮，被褥幹燥
2、洗漱宜用溫水，晚間洗腳，熱水應能浸泡及踝關節以上，時間在15分鍾左右，以促進下肢血液通暢
3、預防感冒
4、保持良好的精神狀態，切不可急躁焦慮，也不可滿不在乎，更不能情緒低落
5、堅持鍛煉身體，以增強體質，提高抗病能力
除非合並其他疾病，纖維肌前綜合征一般無實驗室異常，但有報道纖維肌痛綜合征病人IL-1水平增高，自然殺傷細胞及血清素活性減低，腦脊液中P物質濃度升高，藥1/3病人有雷諾現象，在這一組病人中可有抗核抗體陽性，C3水平減低。
自70年代Smythe首次提出纖維肌痛綜合征診斷標準以來，相繼以許多診斷標準問世，但這些標準在方法學上，內容上都不盡相同，從而給流行病學及臨床研究帶來一些困難，為此國外學者通過多中心協作，在以往標準的基礎上，研究了大量病人的臨床症狀及壓痛點，從中篩選出最有鑒別意義的一個臨床症狀及18個壓痛點，提出了1990年纖維肌痛綜合征的分類標準。
1、持續3個月以上的全身性疼痛：身體的左、右側，腰的上、下部及中軸骨骼(頸椎或前胸或胸椎或下背部)等部位同時疼痛時才認為是全身性疼痛。
2、用拇指按壓(按壓力約為4kg)18個壓痛點中至少有11個疼痛，這18個(9對)壓痛點部位是：枕骨下肌肉附著處、斜方肌上緣中點、第5至第7頸椎橫突間隙的前麵、岡上肌起始部、肩胛棘上方近內側緣、肱骨外上髁遠端2cm處、第二肋骨與軟骨交界處並恰在交界處外側上緣、臀我上象限、臀前皺襞處、大粗隆後方、膝內側脂肪墊關節折皺線的近側，同時滿意上述2個條件者，可診為纖維肌痛綜合征。
應用這個標準可使纖維肌痛綜合征的定義更趨一致，該標準所強調的纖維肌痛綜合征與其他類似疾病的區別處，因而沒有包括綜合征特征性表現，如疲勞、睡眠障礙、晨僵等。應用這個標準時，考慮到上述特點，將會增加診斷的可靠性，正確性，但這個標準不能區分原發性纖維肌痛綜合征和繼發性纖維肌痛綜合征。因此，纖維肌痛綜合征診斷成立後，還必須檢查有無其他伴隨疾病，以區分原發性與繼發性纖維肌綜合征，這種區分在臨床研究及療效觀察顯然是必要的。
無特殊飲食禁忌，平時飲食清淡富於營養，注意膳食平衡。忌辛辣刺激食物。以免造成病情反複的情況，比如說，海鮮、雞肉、狗肉等。與此同時，也不要禁食刺激性的食物。多吃新鮮的蔬菜和水果。新鮮的蔬菜和水果含有大量人體所需的營養成分。多吃提高免疫力的食物，以提高機體抗病能力。推薦以下幾個食療方：
1、附子粥：準備好附子5g，幹薑2.5g，大米90g，蔥白2根，少量紅糖，首先要把附子、幹薑研為極細的粉末，然後取大米煮粥，等到煮沸以後，再調入藥末、蔥白和紅糖，一同煮為稀粥。另有一種做法就是用附子、幹薑水煎取其汁，再同大米、蔥、糖煮粥服食。
2、薏仁山藥豬肚湯：先洗幹淨一個豬肚，再把砂仁、薏仁和新鮮的山藥一起放置在入豬肚裏麵，加水，用麻繩將豬肚口結紮封口，再放入鍋內，加適量水煎製，等熟了之後將豬肚取出，去除裏麵的藥渣，吃豬肚和山藥，喝已經浸入藥香的湯。
3、核桃蔥薑茶：先準備好飽滿的核桃仁、蔥白、生薑各20g，茶葉15g。把核桃仁、蔥白和生薑一起搗爛，同茶葉同時放在砂鍋中，加一碗半水煎沸，之後去渣一次性服下，然後躺在床上用被子蓋上避風捂汗，每天服用一次。
纖維肌痛綜合征屬中醫痹病範疇。中醫中藥治療施行安神養血、疏筋通絡、活血化瘀、行氣止痛，以解除患者的疼痛及睡眠障礙。
本病常有頭痛失眠、心煩易怒、身痛無定處、兩脅脹痛等肝鬱氣滯表現，選柴胡舒肝散加減或六鬱丸方加減，常用中藥：製香附、醋柴胡、杭白芍、全當歸、延胡索、鬱金、炒枳殼、川芎、蒼術、梔子、合歡花、夜交藤、炒棗仁、炙甘草。若身痛如刺，固定不移，夜間痛重，舌質暗紅有淤血或瘀斑等血淤證為主者可選用逐瘀湯或血府逐瘀湯加減，常用中藥：丹參、赤芍、牛膝、地龍、羌活、秦艽、香附、桃仁、紅花、炒靈脂、沒藥、延胡索、川楝子。