種痘並發症一般可歸納成四種。牛痘病毒引起的皮疹，痘苗中蛋白質引起過敏性發疹，種痘合並細菌感染和種痘引發或加劇其他皮膚病。繼發性種痘疹因操作不慎或誤將痘苗玷汙正常皮膚或黏膜引起的痘瘡。由於搔抓等原因將痘苗接種在原有皮膚病上引起的發疹，如發生在嬰兒期的遺傳過敏性濕疹上的牛痘樣濕疹。在種痘後數天發病，表現為接種處皮膚壞死。泛發性牛痘疹，在種痘後數天到2周內發病。全身散在發疹，從丘疹演變到水皰和膿皰，成批發出，從數顆到數十顆。口腔黏膜亦可累及，可伴有發熱，大約3周痊愈。其發病機製是由於種痘後患者形成特異性抗體的時間比較遲緩（正常人約1周），接種的病毒經血液播散而發病。
種痘並發症偶可起腦炎、脊髓炎、周圍神經炎、關節炎、脾大、全身淋巴結腫大、血小板減少性紫癜等。壞疽性牛痘疹常因並發敗血症而死亡。
種痘並發症因接種減毒痘病毒疫苗後在皮膚黏膜上發生的異常反應，本病的臨床表現具體如下。
一、牛痘病毒引起皮疹
1、繼發性種痘疹：因操作不慎或誤將痘苗玷汙正常皮膚或黏膜引起的痘瘡，如痘苗濺入角膜，發病後可影響視力，甚至造成失明。亦可見於唇、舌和其他部位皮膚，有時繼發於初種部位的周圍，排列成衛星狀，從單顆到數十顆，多數在2周內消退，少有超過1個月的。
2、由於搔抓等原因將痘苗接種在原有皮膚病上引起的發疹：如發生在嬰兒期的遺傳過敏性濕疹上的牛痘樣濕疹，也有發生在其他皮膚病如脂溢性皮炎，外陰瘙癢症，馬桶皮炎等皮損上的，這些病人對牛痘病毒的免疫力甚低或沒有免疫力。通常是發生在以往未種過牛痘的嬰幼兒，或雖種過痘，但相隔已久，免疫力已全部或部分消失的成人。也有因搔抓或密切接觸，接種到自身或他人正常皮膚上引起發疹。
3、壞疽性牛痘疹：在種痘後數天發病，表現為接種處皮膚壞死，壞疽性損害不斷向周圍呈漸進性擴大，形成有臍凹的厚壁水皰和膿皰融合組成的灰白色壞死組織或潰瘍，有時在其他遠隔部位出現遷徙性痘瘡，伴有高熱，常因並發敗血症而死亡。這類牛痘疹的產生是由於患者血中丙種球蛋白測定含量雖屬正常，但由於質的缺陷，不能形成足夠抗牛痘病毒的特異性抗體，故抵抗感染能力甚差。臨床上痘瘡呈漸進性擴大，組織壞死或病毒進入血流造成遷徙性病灶。另有人認為，壞疽性牛痘疹的形成，除體液抗體形成問題外，還有細胞免疫問題，隻有兩者全受障礙，才能造成該類嚴重並發症。
4、泛發性牛痘疹：在種痘後數天到2周內發病，全身散在發疹，從丘疹演變到水皰和膿皰，成批發出，從數顆到數十顆，口腔黏膜亦可累及，可伴有發熱，大約3周痊愈。其發病機製是由於種痘後患者形成特異性抗體的時間比較遲緩（正常人約1周），接種的病毒經血液播散而發病，以後隨著機體逐漸產生特異性抗體，即可逐漸痊愈。
二、痘苗中蛋白質引起過敏發疹
本組疹型多見於複種病例，最常見的為多形紅斑型，表現為綠豆到黃豆大斑疹、丘疹、水皰甚至大皰。帶水腫性，中央微凹陷，呈淡紅至暗紅，分布以麵和四肢遠端為主，伴有發熱，在2～3周痊愈，薔薇疹表現往往在接種後8～9天發生，從種痘部位周圍開始，迅即波及全身。基本損害為斑疹，略帶水腫性，呈薔薇紅色，散在分布或融合成片，伴有發熱。3～5天消退，其他尚有麻疹樣、猩紅熱樣、蕁麻疹、紫癜等疹型。
三、種痘合並細菌感染
如膿皰瘡、癤、蜂窩織炎、淋巴管炎，偶見尋常狼瘡，細菌從接種處皮膚傷口進入體內引起。
四、種痘引發或加劇其他皮膚病
曾有報道在接種後數周發生大皰性皮膚病如天皰瘡、皰疹樣皮炎、濕疹或銀屑病等，原有濕疹、銀屑病或天皰瘡的患者可在接種後加劇。
種痘並發症的預防在於種痘時需無菌操作，接種處保持清潔，避免搔抓，痘苗勿濺入眼、口或汙染他處皮膚注意痘苗批號，對反應較多的批號要停用檢查當發生下麵情況時避免種痘
1、有濕疹或過敏性體質者或患其他皮膚病如神經性皮炎、膿皮病、水痘、發疹性疾病、單純皰疹者等
2、免疫缺陷如生理性低丙種球蛋白血症、異常丙種球蛋白血症、惡性腫瘤、任何疾病引起暫時或永久免疫損傷、用激素及免疫抑製療法者
3、神經性疾病如驚厥、腦卒中、種痘後腦炎家族史，以及任何慢性、靜止或進行性神經係統疾病
4、急性發熱性疾病及β溶血性鏈球菌感染
5、孕婦初種，特別是懷孕3個月內，可致胎兒發生致命性泛發性牛痘疹，故在孕期禁忌初種
種痘並發症因接種減毒痘病毒疫苗後在皮膚黏膜上發生的異常反應稱為種痘並發症。種痘並發症需結合患者的實際情況定奪檢查事項，通常先做皮膚檢查。
種痘並發症患者飲食宜清淡為主，注意衛生，合理搭配膳食。患者宜多吃具有清利濕熱作用的食物，而且還要忌煙酒，忌辛辣刺激性食物。
種痘並發症根據不同類型分別處理，具體治療方法如下。
一、對病毒引起的皮疹
1、牛痘樣濕疹、泛發性牛痘疹、壞疽性牛痘疹患者可用幹擾素和幹擾素誘導物及轉移因子、人血丙種球蛋白或凍幹人胎盤血丙種球蛋白（胎盤球蛋白）肌內注射、輸入新近種痘者（4～8周內）血清和其他支持療法。有發熱和皮損廣泛者，並用金黴素等抗生素治療。
2、發生在角膜上的痘瘡，需積極處理。局部以0.1％碘苷溶液（皰疹淨）和0.5％金黴素滴眼液，每隔1h做輪換滴眼，並肌內注射凍幹人胎盤血丙種球蛋白（胎盤球蛋白）或人血丙種球蛋白。
二、對過敏性皮疹
1、抗組胺類藥物。
2、維生素C1g，靜脈注射，每天1次。
3、重症患者可用皮質激素。