一、病原學檢查
1.糞便檢查：
⑴活滋養體檢查法：
常用生理鹽水直接塗片法檢查活動的滋養體。急性痢疾患者的膿血便或阿米巴炎病人的稀便，要求容器幹淨，糞樣新鮮、送檢越快、越好，寒冷季節還要注意運送和檢查時的保溫。檢查時取一潔淨的載玻片，滴加生理鹽水1滴，再以竹簽沾取少量糞親，塗在生理鹽水中，加蓋玻片，然後置於顯微鏡下檢查。典型的阿米巴痢疾糞便為醬紅色粘液樣，有特殊的腥臭味。鏡檢可見粘液中含較多粘集成團的紅細胞和較少的白細胞，有時可見夏科一雷登氏結晶(Charcot—Leyden crystals)和活動的滋養體。這些特點可與細菌性痢疾的糞便相區別。
⑵包囊檢查法：
臨床上常用碘液塗片法，該法簡便易行。取一潔淨的載玻片，滴加碘液1滴，再以竹簽沾取少量糞樣，在碘液中塗成薄片加蓋玻片，然後置於顯微鏡下檢查，鑒別細胞核的特征和數目。
2.阿米巴培養：
已有多種改良的人工培養基，常用的如洛克氏液、雞蛋、血清培養基，營養瓊脂血清鹽水培養基，瓊脂蛋白腖雙相培養基等。但技術操作複雜，需一定設備，且阿米巴人工培養在多數亞急性或慢性病例陽性率不高，似不宜作阿米巴診斷的常規檢查。
3.組織檢查
通過乙狀結腸鏡或纖維結腸鏡直接觀察粘膜潰瘍，並作組織活檢或刮拭物塗片，檢出率最高。據報道乙狀結腸、直腸有病變的病例約占有症狀患者的2/3，因此，凡情況允許的可疑患者都應爭取作結腸鏡檢，刮拭物塗片或取活組織檢查。滋養體的取材必須在潰瘍的邊緣，鉗取後以局部稍見出血為宜。膿腔穿刺液檢查除注意性特征外，應取材於膿腔壁部，較易發策滋養體。
二、免疫診斷
近年來國內外陸續報告了多種血清學診斷方法，其中以間接血凝(IHA)、間接熒光抗體(IFAT)和酶聯免疫吸附試驗(ELISA)研究較多，但敏感性對各型病例不同。IHA的敏感較高，對腸阿米巴病的陽性率達98%，腸外阿米巴病的陽性率達95%，而無症狀的帶蟲者僅10%～40%，IFA敏感度稍遜於IHA。EALSA敏感性強，特異性高，有發展前途。補體結合試驗對診斷外阿米巴亦有圈套意義，其陽性率可達80%以上。其他如明膠彌散沉澱素試驗、皮內試驗等均有輔助診斷的價值。近年來，已有報道應用敏感的免疫學技術在糞便及膿液中檢測阿米巴特異性抗原獲得成功。特別是抗阿米巴雜音瘤單克隆抗體的應用為免疫學技術探測宿主排泄物中病原物質了可靠、靈敏和抗幹擾的示蹤式具。 ㈣診斷性治療：如臨床上高度懷疑而經上述檢查仍不能確診時，可給予足量吐根堿注射或口服安痢平、滅滴靈等治療，如效果明顯，亦可初步作出診斷。
