過濾泡性結膜炎可以選擇抗生素類滴眼液，同時配合激素類滴眼液、非甾體類滴眼液進行治療。妥布黴素滴眼液、左氧氟沙星滴眼劑等都是常見的抗生素類滴眼油，激素類滴眼液主要是氟米龍滴眼液、妥布黴素地塞米鬆滴眼液等，而非甾體類滴眼劑包括雙氯芬酸鈉滴眼膏、普拉洛芬滴眼水等，但是不限於這幾種。
1、妥布黴素滴眼液：可用於治療由敏感細菌引起的外眼局部感染，也可用於眼部附屬器的局部感染。對於濾泡性結膜炎，腎功能不全、肝功能異常、前庭功能異常、重症肌無力、腎功能不全、重症肌無力者禁用；孕婦、哺乳期婦女禁用；
2、左氧氟沙星滴眼液：一般用於治療由葡萄球菌屬、鏈球菌屬、肺炎球菌感染引起的眼部疾病，對於濾泡性結膜炎效果比較好，但是在使用濾泡性結膜炎時，應注意對氧氟沙星、喹羅酮類抗菌製劑過敏的患者禁用。
1、眼瞼炎、結膜炎、角膜炎、鞏膜炎、角膜炎、鞏膜炎等，一般都是用氟米龍滴眼液，但是氟米龍滴眼液隻能做的眼用，不能通過其他途徑給藥，而且兒童、孕婦要謹慎使用；
2、妥布黴素地塞米鬆滴眼液：用於感染性結膜炎、眼瞼等炎性疾病，可以緩解水腫和炎症反應，但是對於妥布黴素地塞米鬆滴眼液過敏的患者禁用。
1、雙氯芬酸鈉滴眼液：一般用於治療眼部炎症，後葡萄膜炎、結膜炎、鞏膜炎，可抑製角膜新生血管的形成，但對於雙氯芬酸鈉滴眼液過敏者禁用，兒童、孕婦慎用；
3、Pralophen滴眼液：適用於眼瞼炎、結膜炎、角膜炎、鞏膜炎等外眼及眼前節炎症，應用時患者應注意避免接觸眼睛，對於普拉洛芬過敏的患者不能使用。
引起濾泡性結膜炎的原因目前還不清楚，檢查時可以發現下瞼穹隆和下瞼結膜有大小均勻排列整齊的濾泡，濾泡無融合傾向，有時可見結膜充血且有分泌物，但結膜並不肥厚。如果發生濾泡性結膜炎，病人應該及時去醫院進行治療，治療時要注意個人物品的隔離，以免傳染給家人。
