1、西醫治療：口服激素，注射激素。很多人都選擇西醫治療，因為它見效較快，但有很大的弊端，就是停藥後就會回縮，再者就是由於量把握不準，經常會出現一些過敏現象，常見的有嘔吐，起紅疹，呼吸不暢甚至暫時性休克。
2、中醫治療：辯證治，鹿陽參從體質和生活習慣調理身體，使陰莖增大增粗增長的同時，使身體達到健康體態。
陰莖的大小主要是受遺傳因素的影響，真性男性陰莖短小症是多見於先天性，少數為後天的。
先天性小睾丸症，陰莖也短小，由於睾丸分泌男性激素不足，因而缺乏性欲和正常性功能，雖然可以使用睾丸酮來治療，但隻能增強性功能，而不能生育。先天性真性男性陰莖短小有的可以通過陰莖延長術來改變。
後天性的陰莖短小，主要因睾丸痿縮引起，如：長其從事超聲、微波、放射線、高溫等作業的男性，青春期前腮脈炎合並睾丸寒，長期食用粗製棉籽油等，均可引起睾丸痿縮。
後天性真性男性陰莖短小症的睾丸分泌雄激素功能正常，性染色體也正常，主要是精子生成障礙而引起不育症，但並不影響生殖器官及第二性征的發育，也不影響正常的性欲和性功能。後天性的真性男性陰莖短小症，經過治療或避免損傷，睾丸功能的工作，是可能逐步得以恢複的。陰莖短小男性不必自卑，部分男性還是可以通過一些按摩手段和藥物來達到恢複的。
