指甲蓋凹凸不平有小坑可能是營養不良、指甲受傷、真菌感染等因素所致，容易影響指甲的健康。
1、營養不良：如果在日常生活中攝入的營養成分不足，就有可能會導致指甲出現凹凸不平的情況，需要多吃一些優質蛋白類的食物，及時補充身體所需營養。
2、指甲受傷：在指甲受到外力損傷之後，也有可能會導致指甲出現凹凸不平的症狀，一般在一段生長之後就會好轉。
3、真菌感染：指甲在受到針對感染之後，也有可能會造成灰指甲的症狀，而且會造成指甲凹凸不平和指甲發黃。可以在醫生指導下通過氟康唑乳膏和酮康唑乳膏、伊曲康唑乳膏等藥膏塗抹。
除了以上原因，也不排除是缺乏微量元素等，還需要到醫院做檢查才能明確。
