1.病因
（1）病原體：百日咳杆菌，有莢膜，無鞭毛，本菌對外界抵抗力弱。
（2）傳染源：患者、隱性感染者和帶菌者。
（3）傳播途徑：主要通過飛沫傳播。
（4）易感人群：人群普遍易感，但幼兒發病率最高。
（5）流行特征：本病發生於各世界各地，多見於溫帶及寒帶。一般散在發病。
2.發病機製
百日咳杆菌在呼吸道上皮細胞纖毛上繁殖並產生毒素和毒素性物質，引起上皮細胞纖毛的麻痹和細胞變性壞死，使呼吸道炎症所產生的黏稠分泌物排除障礙。
3.病理
主要引起支氣管和細支氣管黏膜的損害。
呼吸係統並發症
肺炎最為常見，多為繼發感染所致。痙咳可減輕，患兒出現高熱、氣促、紫紺及肺部囉音。其他還可出現肺不張、肺氣腫和支氣管擴張等。原有肺結核患者再患本病可促使結核病變活動。
中樞神經係統並發症
百日咳腦病是本病最嚴重的並發症，發病率約2～3％。嚴重痙咳引起腦缺氧、水腫、血管痙攣或出血。表現為驚厥或反複抽搐、高熱、昏迷。恢複後可留有偏癱等神經係統後遺症。
其他
如結膜下出血、臍疝、腹股溝和脫肛等。
1.前驅期：類似感冒，可有發熱、咳嗽、流涕及噴嚏等。
2.痙咳期：特點為陣發性痙攣性咳嗽，每日數次至數十次，以夜間為多。每當痙咳時涕淚交流，麵紅耳赤，舌向外伸，口唇發紺，頸靜脈怒張。咳畢接著一次深長吸氣，發出雞鳴樣吼聲。如此反複直至吐出大量黏稠痰液和胃內容物，咳嗽方暫停止。主要體征：眼瞼水腫，眼結膜出血，舌係帶潰瘍。
3.恢複期：陣咳逐漸減少至完全消失。
1、管理傳染源和切斷傳播途徑
發現病人應立即作疫情報告，並立即對患者進行隔離和治療，這是防止本病傳播的關鍵
2、保護易感人群
(1)自動免疫：目前已用於預防接種的百日咳菌苗有兩種，全細胞菌苗和無細胞菌苗我國計劃免疫應用的為全細胞菌苗常用的疫苗是白喉類毒素、百日咳菌苗、破傷風類毒素(DPT)三聯製劑一般於出生後3個月開始初種，每月1次，共3次注射量分別為0.5ml、1ml、1ml次年再加強注射1次
全細胞百日咳菌苗注射1～2天，可有輕、中度發熱極個別人注射後48h內出現休克，或注射後數天或數周內出現腦病有過敏史、家族中有精神、神經病史和急性感染均不宜作此疫苗注射
(2)被動免疫：未接受過預防注射的體弱嬰兒接觸百日咳病例後，可注射含抗毒素的免疫球蛋白預防
3、藥物預防
對沒有免疫力而有百日咳接觸史的嬰幼兒主張進行藥物預防，可服用紅黴素或複方新諾明7～10日
1、血常規檢查
發病早期，外周血白細胞計數升高，痙咳期最為明顯。白細胞計數常為(20～50)×109/L，其中以淋巴細胞為主，一般>60％，亦有高達>90％者，多為成熟的小淋巴細胞，是因淋巴細胞促進因子促使脾及其他淋巴器官釋放至血的淋巴細胞增加，並使血中淋巴細胞進入毛細血管及淋巴管減少。有繼發感染時中性粒細胞增高。
2、細菌學檢查
(1)細菌培養：發病早期采用鼻咽拭子或咳碟法培養陽性率較高，發病第1周可達90％左右，以後逐漸降低，至第4周陽性率隻有2％。鼻咽拭子法：是用棉拭子經鼻腔進人，取鼻咽部分泌物接種於培養皿中。咳碟法：當患者咳嗽時用含血培養基平皿置於距患者口部5～10cm處，待飛沫人平皿內，立即將咳碟送37℃溫箱培養，目前認為鼻咽拭培養法優於咳碟法。
(2)單克隆抗體菌落印跡試驗：用抗百日咳杆菌和單克隆抗體菌落印跡試驗檢測待檢標本，與二者均呈陽性斑點反應者為百日咳杆菌。此法快速，48h可出結果，敏感性高，可用於早期診斷。
(3)熒光抗體法：用鼻咽拭分泌物塗片，或鼻腔黏膜壓片，以熒光抗體染色檢測特異抗原。在早期陽性率達75％～85％可協助診斷，但要注意有假陽性。
3、血清學檢查
留取急性期和恢複期雙份血清。用血凝抑製試驗或補體結合試驗方法，檢測特異性抗體，主要用於回顧性診斷或不典型病例的輔助診斷；酶聯免疫吸附試驗可以測定百日咳特異性IgM、IgG、IgA抗體作為早期診斷的依據，對細菌培養陰性者更有意義。
4、分子生物學檢測
用PCR檢測患者鼻咽分泌物百日咳杆菌DNA，具有快速、敏感、特異的診斷價值。
5、嘌呤環化酶(AC)活性檢測
此法最大的優點是快速，且陽性率高，用於早期診斷有較大前途。
百日咳患者的適宜飲食
宜選擇細、軟、爛易消化吸收，且宜吞咽的半流質或軟食。因病程較長，注意選擇熱能高、含優質蛋白質、營養豐富的食物。
百日咳患者的飲食禁忌
1、甜食：如巧克力、糖果、甜點心、奶油蛋糕、白糖、紅糖等有助濕增熱作用，會增加痰液的分泌，降低百日咳的治療效果。
2、生冷食物：生冷之物往往損傷脾胃，導致脾胃運化失調而使肌體康複功能減弱，並且使痰量增多。而百日咳患兒往往在食入生冷之物後咳嗽加劇，特別是棒冰、冰凍汽水、冰淇淋。這些食品又冷又甜，吃下去後咳嗽加劇是常見的事情。
3、海鮮發物：百日咳對海腥、河鮮之類食物特別敏感。咳嗽期間食入海腥之物，會導致咳嗽加劇。這類食物包括海蝦、梭子蟹、帶魚、牛肉、淡菜、河海鰻、螃蟹等。
4、辛辣油膩食物：薑、蒜、辣椒、胡椒等辛辣之品對氣管黏膜有刺激作用，可加重炎性改變。肥肉、油炸食品等油膩之物易損傷脾胃，可使病情加重。
(1)初咳期(風邪鬱肺)：初起咳嗽，噴嚏，流涕，或伴發熱，2~3日咳嗽漸增，痰稀白，量不多，或痰稠不易咯出，咳聲不暢，夜間為重，舌質淡紅、苔薄白或薄黃，脈浮。
治法：疏風宜肺。
主藥；桑葉10克，桑白皮10克，菊花10克，防風6克，牛蒡子10克，杏仁10克，桔梗6克，貝母10克，前胡10克，蟬衣6克。
(2)痙咳期(痰熱閉肺)：咳時連咳持續，咳畢有雞啼樣吸氣性回聲，必待吐出痰涎及食物後痙咳才得暫時緩解。咳時彎腰曲背，引頸伸舌，麵赤眼瞼浮腫，甚或目睛出血，舌下係帶潰瘍，舌紅苔黃，脈滑數。
治法：瀉肺鎮咳。
方藥：桑白皮10克，黃芩10克，川貝母6克，半夏6克，蘇子6克，山梔6克，鉤藤10克，白僵蠶10克，炙杷葉10克，白茅根15克。
中成藥：鷺鴛咯丸，每次1丸，每日2~3次。
(3)恢複期(氣陰兩虛)：咳嗽逐漸減輕或見幹咳少痰，多汗，舌質紅、舌苔光剝或少苔，脈細數；或見咳聲無力，精神萎頓，食欲不振，舌淡苔白，脈虛弱無力。
治法：潤肺健脾。
方藥：沙參10克，太子參10克，麥冬10克，五味子10克，生黃芪10克，玉竹10克，天花10克，生甘草6克，杏仁10克，全瓜萎15克。
中成藥：玉屏風散，每次1袋，每日2次。