HIV相關呼吸道感染發病率高，究其原因目前尚不完全清楚。近來研究發現肺泡巨噬細胞亦是人類免疫缺陷病毒（HIV）攻擊的靶細胞之一，細胞數量未見減少，但功能（抗原呈遞等）降低。支氣管肺泡灌洗液中輔助T細胞/抑製性T細胞(T4H/TS）比例降低，TS升高。HIV病毒負荷量與CD4細胞耗竭呈線形相關，而血液中CD4細胞是預測免疫缺陷和肺部機會性感染發生可能性、感染類型及其病原譜的重要指標。
HIV相關呼吸道感染可並發各種嚴重的細菌、真菌和（或）病毒感染。合並肺部真菌感染，症狀重，確診前一般都有長期應用抗生素治療史，是嚴重威脅艾滋病患者生命的疾病，常見的真菌主要是念珠菌屬、曲黴屬、隱球菌屬、接合菌（主要是毛黴）和肺孢子菌等。
HIV相關呼吸道感染者呼吸道症狀的發生率隨著CD4+計數的下降而升高。臨床表現缺乏診斷特異性，因為HIV感染者其他並發症均可發生咳嗽、呼吸困難等呼吸道症狀。但某些臨床症狀對於提示診斷線索仍是有幫助的，例如咳嗽的性質需區分是咳黃膿痰還是無痰幹咳，前者通常需考慮細菌性肺炎，後者則以卡氏肺孢子蟲肺炎（PCP）多見。
發熱和體重下降提示全身性或播散性疾病，如分枝杆菌或真菌感染等。肺外症狀有助於診斷，如CD4
HIV並發肺部感染可出現發熱、心動過速、發紺、低血壓，常提示其為一種急性病程（如細菌性敗血症）。
HIV相關呼吸道感染主要是預防艾滋病病毒（HIV）的感染，其具體預防措施如下所述
1、堅持潔身自愛，不賣淫、嫖娼，避免婚前、婚外性行為
2、嚴禁吸毒，不與他人共用注射器
3、不要擅自輸血和使用血製品，要在醫生的指導下使用
4、不要借用或共用牙刷、剃須刀、刮臉刀等個人用品
5、使用安全套是性生活中最有效的預防性病和艾滋病的措施之一
6、要避免直接與艾滋病患者的血液、精液、乳汁和尿液接觸，切斷其傳播途徑
HIV相關呼吸道感染的檢查包括血液檢查、動脈血氣分析及其他輔助檢查，其具體檢查方法如下所述。
一、血常規
HIV感染者並發肺部細菌性感染血白細胞計數較基礎值升高（因HIV感染者其白細胞基礎值常低於正常值），伴核左移。HIV伴粒細胞缺乏時肺部細菌和真菌（如曲菌）感染的危險性明顯增加。
二、血清乳酸脫氫酶（LDH）
若為卡氏肺孢子蟲肺炎（PCP）時，血清LDH通常升高，但在其他肺部疾病（如細菌性肺炎和結核）或非肺部疾病時亦可升高，故缺乏特異性。LDH在嚴重PCP患者中具有較高的敏感性，相反病情較輕的PCP則LDH的敏感性差。LDH值與PCP治療反應及預後相關。
三、動脈血氣
HIV感染者並發肺部感染時通常動脈血氣異常，如低氧血症、肺泡-動脈血氧分壓差[PO2（A-a）]加大。二氧化碳性堿中毒，但缺乏診斷特異性。對於PCP，則對判斷預後和決定是否收住入院，或是否用糖皮質激素有幫助。
四、其他輔助檢查
1、胸部X線檢查胸片可以為HIV肺部感染的診斷提供線索，並為診斷步驟選擇提供參考。
2、胸部CT檢查對於肺部多發病變的鑒別診斷有一定幫助。如果大多數結節直徑小於1cm，且沿著支氣管中心性分布，一般多為肺部機會性感染；如伴有胸腔內淋巴結腫大，且結節大於1cm則考慮新生物。卡波西肉瘤除肺內結節外常伴有支氣管周圍血管增寬。
HIV相關呼吸道感染患者宜吃具有增加免疫力作用的食物；宜吃蛋白質含量高的食物；宜吃具有消炎作用的食物；宜吃具有抗病毒作用的食物。忌吃酒精含量高的食物；忌吃辛辣燥的食物；忌吃容易誘發感染的食物；忌吃寒涼的食物。
HIV相關呼吸道感染，其抗微生物治療與一般患者基本相同，但應注意HIV/AIDS者抗感染化學治療時毒副反應發生率較高且嚴重，應密切觀察和防範。
抗HIV治療需參照CD4+和病毒含量。若CD4+<500μl和病毒含量每毫升>500拷貝者有治療指征；CD4+>500/μl和病毒含量>500拷貝者是否治療尚無統一意見，若病人合作則可以治療；CD4+<200/μl而病毒含量低於可檢測水平者，不治療，定期複查。
最常用治療方案是兩種核苷酸反轉錄酶抑製劑（NRTIs）和一種蛋白酶抑製劑（PI）。